Protein–RNA interactions for Protein: Q01448

HPC2, Histone promoter control protein 2, yeastyeast

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HPC2Q01448 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.57■■□□□ 1.68
HPC2Q01448 NOP1YDL014W 984 nt25.18■■□□□ 1.62
HPC2Q01448 NSR1YGR159C 1245 nt24.88■■□□□ 1.57
HPC2Q01448 YKL036CYKL036C 393 nt23.85■■□□□ 1.41
HPC2Q01448 YJL027CYJL027C 417 nt22.37■■□□□ 1.17
HPC2Q01448 Q0297Q0297 156 nt22.27■■□□□ 1.16
HPC2Q01448 SCS3YGL126W 1143 nt22.03■■□□□ 1.12
HPC2Q01448 SRX1YKL086W 384 nt22.01■■□□□ 1.11
HPC2Q01448 MDJ1YFL016C 1536 nt21.39■■□□□ 1.02
HPC2Q01448 YCR051WYCR051W 669 nt20.88■□□□□ 0.93
HPC2Q01448 YOL085CYOL085C 342 nt20.63■□□□□ 0.89
HPC2Q01448 SCJ1YMR214W 1134 nt20.43■□□□□ 0.86
HPC2Q01448 PKP1YIL042C 1185 nt20.18■□□□□ 0.82
HPC2Q01448 RPP1BYDL130W 321 nt19.97■□□□□ 0.79
HPC2Q01448 ATS1YAL020C 1002 nt19.91■□□□□ 0.78
HPC2Q01448 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.49■□□□□ 0.71
HPC2Q01448 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.49■□□□□ 0.71
HPC2Q01448 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.49■□□□□ 0.71
HPC2Q01448 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.49■□□□□ 0.71
HPC2Q01448 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.49■□□□□ 0.71
HPC2Q01448 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.49■□□□□ 0.71
HPC2Q01448 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.49■□□□□ 0.71
HPC2Q01448 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.49■□□□□ 0.71
HPC2Q01448 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.49■□□□□ 0.71
HPC2Q01448 CCC1YLR220W 969 nt19.25■□□□□ 0.67
HPC2Q01448 DBP2YNL112W 1641 nt19.23■□□□□ 0.67
HPC2Q01448 SCR1SCR1 522 nt18.98■□□□□ 0.63
HPC2Q01448 PET122YER153C 765 nt18.97■□□□□ 0.63
HPC2Q01448 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.65■□□□□ 0.58
HPC2Q01448 RRN5YLR141W 1092 nt18.5■□□□□ 0.55
HPC2Q01448 RTC3YHR087W 336 nt18.49■□□□□ 0.55
HPC2Q01448 PST2YDR032C 597 nt18.33■□□□□ 0.52
HPC2Q01448 RSB1YOR049C 1065 nt18.31■□□□□ 0.52
HPC2Q01448 RVS167YDR388W 1449 nt18.26■□□□□ 0.51
HPC2Q01448 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.15■□□□□ 0.5
HPC2Q01448 YBR190WYBR190W 312 nt18.12■□□□□ 0.49
HPC2Q01448 YDJ1YNL064C 1230 nt18.07■□□□□ 0.48
HPC2Q01448 YKL097CYKL097C 411 nt17.95■□□□□ 0.46
HPC2Q01448 SHR5YOL110W 714 nt17.78■□□□□ 0.44
HPC2Q01448 GAR1YHR089C 618 nt17.5■□□□□ 0.39
HPC2Q01448 SHU1YHL006C 453 nt17.4■□□□□ 0.38
HPC2Q01448 Q0182Q0182 405 nt17.24■□□□□ 0.35
HPC2Q01448 YOR139CYOR139C 393 nt17.1■□□□□ 0.33
HPC2Q01448 DEP1YAL013W 1218 nt16.99■□□□□ 0.31
HPC2Q01448 MOT3YMR070W 1473 nt16.93■□□□□ 0.3
HPC2Q01448 TIR1YER011W 765 nt16.91■□□□□ 0.3
HPC2Q01448 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.88■□□□□ 0.29
HPC2Q01448 YNL208WYNL208W 600 nt16.86■□□□□ 0.29
HPC2Q01448 URN1YPR152C 1398 nt16.84■□□□□ 0.29
HPC2Q01448 NPL3YDR432W 1245 nt16.81■□□□□ 0.28
HPC2Q01448 RPN10YHR200W 807 nt16.79■□□□□ 0.28
HPC2Q01448 SSA1YAL005C 1929 nt16.55■□□□□ 0.24
HPC2Q01448 OPI9YLR338W 858 nt16.49■□□□□ 0.23
HPC2Q01448 YGR021WYGR021W 873 nt16.42■□□□□ 0.22
HPC2Q01448 YOL037CYOL037C 354 nt16.42■□□□□ 0.22
HPC2Q01448 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.39■□□□□ 0.21
HPC2Q01448 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.39■□□□□ 0.21
HPC2Q01448 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.39■□□□□ 0.21
HPC2Q01448 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.39■□□□□ 0.21
HPC2Q01448 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.39■□□□□ 0.21
HPC2Q01448 SRB2YHR041C 633 nt16.38■□□□□ 0.21
HPC2Q01448 HOM6YJR139C 1080 nt16.38■□□□□ 0.21
HPC2Q01448 MNP1YGL068W 585 nt16.36■□□□□ 0.21
HPC2Q01448 WWM1YFL010C 636 nt16.26■□□□□ 0.19
HPC2Q01448 SAH1YER043C 1350 nt16.16■□□□□ 0.18
HPC2Q01448 RKM5YLR137W 1104 nt16.13■□□□□ 0.17
HPC2Q01448 YJR018WYJR018W 363 nt16.12■□□□□ 0.17
HPC2Q01448 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.03■□□□□ 0.16
HPC2Q01448 PUN1YLR414C 792 nt16.03■□□□□ 0.16
HPC2Q01448 YJR120WYJR120W 351 nt16.02■□□□□ 0.16
HPC2Q01448 PUS2YGL063W 1113 nt16.01■□□□□ 0.15
HPC2Q01448 RPP2BYDR382W 333 nt15.99■□□□□ 0.15
HPC2Q01448 YLR281CYLR281C 468 nt15.97■□□□□ 0.15
HPC2Q01448 BSC6YOL137W 1494 nt15.91■□□□□ 0.14
HPC2Q01448 PUT4YOR348C 1884 nt15.91■□□□□ 0.14
HPC2Q01448 SSA3YBL075C 1950 nt15.87■□□□□ 0.13
HPC2Q01448 ARE1YCR048W 1833 nt15.83■□□□□ 0.12
HPC2Q01448 WHI5YOR083W 888 nt15.8■□□□□ 0.12
HPC2Q01448 BDH2YAL061W 1254 nt15.79■□□□□ 0.12
HPC2Q01448 LSM3YLR438C-A 270 nt15.74■□□□□ 0.11
HPC2Q01448 MRPL8YJL063C 717 nt15.7■□□□□ 0.1
HPC2Q01448 PTC2YER089C 1395 nt15.67■□□□□ 0.1
HPC2Q01448 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.61■□□□□ 0.09
HPC2Q01448 FMP45YDL222C 930 nt15.6■□□□□ 0.09
HPC2Q01448 DSK2YMR276W 1122 nt15.55■□□□□ 0.08
HPC2Q01448 YPR011CYPR011C 981 nt15.54■□□□□ 0.08
HPC2Q01448 YCH1YGR203W 447 nt15.51■□□□□ 0.07
HPC2Q01448 IMP2'YIL154C 1041 nt15.5■□□□□ 0.07
HPC2Q01448 INM2YDR287W 879 nt15.49■□□□□ 0.07
HPC2Q01448 YLR236CYLR236C 324 nt15.45■□□□□ 0.06
HPC2Q01448 POA1YBR022W 534 nt15.45■□□□□ 0.06
HPC2Q01448 YBL100CYBL100C 315 nt15.42■□□□□ 0.06
HPC2Q01448 ADO1YJR105W 1023 nt15.41■□□□□ 0.06
HPC2Q01448 NAB2YGL122C 1578 nt15.4■□□□□ 0.06
HPC2Q01448 TRM9YML014W 840 nt15.37■□□□□ 0.05
HPC2Q01448 DAL1YIR027C 1383 nt15.33■□□□□ 0.04
HPC2Q01448 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.32■□□□□ 0.04
HPC2Q01448 UBX6YJL048C 1191 nt15.31■□□□□ 0.04
HPC2Q01448 BUD23YCR047C 828 nt15.29■□□□□ 0.04
HPC2Q01448 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.29■□□□□ 0.04
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