RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
RNQ1	YCL028W	PXL1	P36166	706 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RNQ1	YCL028W	TGL3	P40308	642 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RNQ1	YCL028W	TPO2	P53283	614 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RNQ1	YCL028W	YML020W	Q03722	664 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RNQ1	YCL028W	HFI1	Q12060	488 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RNQ1	YCL028W	ATG9	Q12142	997 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RNQ1	YCL028W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
RNQ1	YCL028W	MAM3	Q12296	706 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RNQ1	YCL028W	SPC110	P32380	944 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	AFG3	P39925	761 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	COS5	P47187	383 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	HFM1	P51979	1187 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	CUL3	P53202	744 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	YCG1	Q06680	1035 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	PLP2	Q12017	286 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	APL4	Q12028	832 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	DPH2	P32461	534 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	MNR2	P35724	969 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	VFA1	P40080	203 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	JJJ3	P47138	172 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	VPS62	P53285	467 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	DON1	Q05610	365 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	XRS2	P33301	854 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	KTR2	P33550	425 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	AIM21	P40563	679 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	SAD1	P43589	448 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	OSW7	P43611	510 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	UME1	Q03010	460 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	HMI1	Q12039	706 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	ECM29	P38737	1868 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	NIP100	P33420	868 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.11	□□□□□ -0.47	not detected
RNQ1	YCL028W	VID24	P38263	362 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.11	□□□□□ -0.47	not detected
RNQ1	YCL028W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	SHE10	P53075	577 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	VPS72	Q03388	795 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	YLR297W	Q05899	129 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	WHI2	P12611	486 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	MSS51	P32335	436 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	TMT1	P32643	299 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	SMC1	P32908	1225 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	FIG4	P42837	879 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	ORC5	P50874	479 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	ENV11	P53246	860 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	YPR078C	Q06813	372 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	SPO12	P17123	173 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	DUR3	P33413	735 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	PCH2	P38126	564 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	NPP2	P39997	493 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	YAP5	P40574	245 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	TRS130	Q03660	1102 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	ECM7	Q06200	448 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	SLX4	Q12098	748 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNQ1	YCL028W	UIP5	P36137	443 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	LDH1	P38139	375 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	IES1	P43579	692 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	SMC3	P47037	1230 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	VPS38	Q05919	439 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	ESC2	Q06340	456 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	ATG3	P40344	310 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	AZR1	P50080	613 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.07	□□□□□ -0.48	not detected
RNQ1	YCL028W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	SHS1	Q07657	551 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	TUP1	P16649	713 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	MMS4	P38257	691 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	ERG5	P54781	538 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	CTR9	P89105	1077 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	TBF1	Q02457	562 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	YOL098C	Q12496	1037 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	ZPS1	Q12512	249 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	SDS3	P40505	327 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.05	□□□□□ -0.48	not detected
RNQ1	YCL028W	RGA2	Q06407	1009 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	OPY2	Q06810	360 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	MTF2	P10849	440 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	SWI3	P32591	825 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	JNM1	P36224	373 aa		12.04	□□□□□ -0.48

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.3 ms