RNA–Protein interactions for RNA: YCL008C

STP22, Transcript of Component of the ESCRT-I complex, yeast

Gene STP22, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STP22	YCL008C	SPE2	P21182	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	BRN1	P38170	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	ALR2	P43553	858 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	TCB2	P48231	1178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	ECL1	P48235	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	ERP6	P53198	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	EAF1	Q06337	982 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	UBX5	Q06682	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
STP22	YCL008C	ROX1	P25042	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	APL1	P27351	700 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SEG2	P34250	1132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	VMR1	P38735	1592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	GIC1	P38785	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	RSM24	Q03976	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	XYL2	Q07993	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	FLC1	Q08967	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	IML1	P47170	1584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SRM1	P21827	482 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	ARE1	P25628	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	PPH3	P32345	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SIT1	P39980	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	NPP2	P39997	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SRT1	Q03175	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	CIT1	P00890	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	NPP1	P25353	742 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	AFR1	P33304	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	CCC2	P38995	1004 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	TPO2	P53283	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	MRPL22	P53881	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	NUP192	P47054	1683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	PCT1	P13259	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	CMP2	P14747	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	FUN30	P31380	1131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YAP1801	P38856	637 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	DJP1	P40564	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	GYP7	P48365	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	SNO2	P53823	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	MSC2	Q03455	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	CDA2	Q06703	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	OSW2	Q12202	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	ADE8	P04161	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	GAL10	P04397	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YRO2	P38079	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	ERT1	P38140	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YBR284W	P38150	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	AVT1	P47082	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	SFB2	P53953	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	RPN4	Q03465	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	TAF8	Q03750	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	PPM2	Q08282	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
STP22	YCL008C	SNF2	P22082	1703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	TOP3	P13099	656 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	CDC11	P32458	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YAP3	P38749	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YER158C	P40095	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	RTS3	P53289	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
STP22	YCL008C	PLB2	Q03674	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	SGD1	Q06132	899 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	CAN1	P04817	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	RNQ1	P25367	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	ELM1	P32801	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	LAM1	P38851	1228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	NIT1	P40447	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	HUL4	P40985	892 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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