RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT1	YBL048W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	ADE8	P04161	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	YHL017W	P38745	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	DLT1	Q04216	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	MET3	P08536	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	CLN2	P20438	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	PPH3	P32345	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	RPD3	P32561	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	ELO3	P40319	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	VPS30	Q02948	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	ADY4	Q05955	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	OPI10	Q08202	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	DAS1	P47005	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	PIN2	Q12057	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	SWM1	Q12379	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	YKL069W	P36088	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	HDA1	P53973	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	SUT2	Q12286	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	YRO2	P38079	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT1	YBL048W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	PBY1	P38254	753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	MRPS35	P53292	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	MRP8	P35719	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	RPP1	P38786	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	FKH2	P41813	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	YBR053C	P38235	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	YHR078W	P38799	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	MUP1	P50276	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	CWC24	P53769	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	MAD1	P40957	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	CEP3	P40969	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	LCD1	Q04377	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	ERT1	P38140	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	TOK1	P40310	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	IRR1	P40541	1150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	YJL163C	P46996	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	TPO2	P53283	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	ASI2	P53895	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	PRI2	P20457	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	TDP1	P38319	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	TAH11	P47112	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	AMA1	P50082	593 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	BNR1	P40450	1375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	REC104	P33323	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	VHR1	P40522	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	COQ11	Q05892	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRT1	YBL048W	PEX2	P32800	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	STE5	P32917	917 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	IMO32	P53219	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	RIA1	P53893	1110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	SVF1	Q05515	481 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	PPZ2	P33329	710 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	FLO10	P36170	1169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	PCL5	P38794	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	CDC43	P18898	376 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	YIR042C	P40586	236 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	PFD1	P46988	109 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
RRT1	YBL048W	PKH1	Q03407	766 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	CRR1	Q05790	422 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	SCT1	P32784	759 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	IRC13	Q08630	104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	NGG1	P32494	702 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	YIL166C	P40445	542 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	PUS2	P53167	370 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	HOF1	Q05080	669 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	ARO10	Q06408	635 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	SGO1	Q08490	590 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	ENV7	Q12003	364 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRT1	YBL048W	YLR415C	O13578	112 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRT1	YBL048W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRT1	YBL048W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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