RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	PRE3	P38624	215 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	HUL4	P40985	892 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	RIM21	P48565	533 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	HFM1	P51979	1187 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	FOL1	P53848	824 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	CKA2	P19454	339 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	PET10	P36139	283 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	RGD1	P38339	666 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	RGA1	P39083	1007 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	RRN7	P40992	514 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	IES1	P43579	692 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	MIC19	P43594	170 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YGR153W	P48238	217 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	VTC3	Q02725	835 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	VPS30	Q02948	557 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	MRX10	Q05648	414 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YLH47	Q06493	454 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	SMC6	Q12749	1114 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	RAD1	P06777	1100 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	MIP1	P15801	1254 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ACE2	P21192	770 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	PFF1	P38244	976 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ERG7	P38604	731 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	DSN1	P40568	576 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ASE1	P50275	885 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	CBK1	P53894	756 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YMR102C	Q03177	834 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	NGL3	Q03210	505 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	SOV1	Q04748	898 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YOL075C	Q08234	1294 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	DAS2	Q12084	232 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	NUC1	P08466	329 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	GSY1	P23337	708 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	APL1	P27351	700 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ISF1	P32488	338 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	NIP100	P33420	868 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	TOS1	P38288	455 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	VPS45	P38932	577 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	PXA1	P41909	870 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YMR074C	Q04773	145 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ADY4	Q05955	493 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	STE23	Q06010	1027 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YPR078C	Q06813	372 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YOL087C	Q99247	1116 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ARG82	P07250	355 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	HXT1	P32465	570 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	SMC1	P32908	1225 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	JNM1	P36224	373 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	GSM1	P42950	618 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	TOS3	P43637	560 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	RPA14	P50106	137 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	MSN5	P52918	1224 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ENV11	P53246	860 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	LSB1	P53281	241 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	TOF1	P53840	1238 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ERO1	Q03103	563 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	YPL216W	Q08964	1102 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	ZRT2	Q12436	422 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PUS1	YPL212C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	SRM1	P21827	482 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	RAD53	P22216	821 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	PRE8	P23639	250 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	XRS2	P33301	854 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	SIP3	P38717	1229 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	TDA3	P38758	523 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	EMP47	P43555	445 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	CIT3	P43635	486 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	NSG2	P53898	299 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
PUS1	YPL212C	VTI1	Q04338	217 aa		5.52	□□□□□ -1.53

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