RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	TRE1	Q08919	783 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	SSM4	P40318	1319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	ADP1	P25371	1049 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	PRO1	P32264	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	NEM1	P38757	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	PEX7	P39108	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	TIM54	P47045	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	YGR122W	P53272	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	FOL1	P53848	824 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIR3	YKL163W	RAD4	P14736	754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	RPN12	P32496	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	FUI1	P38196	639 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	NIT1	P40447	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	SPO20	Q04359	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	ENT2	Q05785	613 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	CYC8	P14922	966 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	RAD27	P26793	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	SFP1	P32432	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	PEX13	P80667	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	TAF8	Q03750	510 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	TOS4	Q06266	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	CDA2	Q06703	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	RSF2	P46974	1380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	PPH3	P32345	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	TIM23	P32897	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	NNK1	P36003	928 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	PTC7	P38797	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	DAS1	P47005	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	ATG16	Q03818	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	SLX4	Q12098	748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	HIF1	Q12373	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	MSH3	P25336	1018 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	YKL133C	P36066	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	GTS1	P40956	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	PEX8	P53248	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	TPP1	Q03796	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	DAL4	Q04895	635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	PPM2	Q08282	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	NYV1	Q12255	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	SHU2	P38957	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	TAT2	P38967	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	YAR028W	P39548	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	MRPS18	P42847	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	YGR021W	P53212	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	ULP1	Q02724	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	SPO75	Q07798	868 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	ADR1	P07248	1323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	ATP4	P05626	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	BLI1	P35727	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	YKR075C	P36155	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	YNR063W	P53749	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	ORC3	P54790	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	FLC1	Q08967	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	SLM3	Q12093	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	SPT7	P35177	1332 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIR3	YKL163W	PRI2	P20457	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	MTC2	P34246	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	XKS1	P42826	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	TAF1	P46677	1066 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	RSM26	P47141	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	TYW3	P53177	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
PIR3	YKL163W	OPI10	Q08202	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	MCD1	Q12158	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	ERP4	Q12450	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	CDC34	P14682	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	THI80	P35202	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65.5 ms