RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	YOR131C	Q12486	218 aa		5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	ADE8	P04161	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	GAL10	P04397	699 aa		4.99	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	GAL11	P19659	1081 aa		4.99	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	YER158C	P40095	573 aa		4.99	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	SNO2	P53823	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	MRPL22	P53881	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	CIT2	P08679	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	CDC11	P32458	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	PET10	P36139	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	TOK1	P40310	691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	NIT1	P40447	199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	YKE2	P52553	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	PLB2	Q03674	706 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	LCD1	Q04377	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	SGD1	Q06132	899 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
THP2	YHR167W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	TIM23	P32897	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	HUL4	P40985	892 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	YKL222C	P35995	705 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	LAM1	P38851	1228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	ROT1	Q03691	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	CDA1	Q06702	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	SRP101	P32916	621 aa		4.95	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	MND2	P40577	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	CDC6	P09119	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	YCR015C	P25616	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	RPC82	P32349	654 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	REC104	P33323	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	MEF2	P39677	819 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	NUP82	P40368	713 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	TAF1	P46677	1066 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	DUS4	Q06063	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	ENA1	P13587	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	DOM34	P33309	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	GCN5	Q03330	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	ESC8	Q08119	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	ENV7	Q12003	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	SOD2	P00447	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	SCT1	P32784	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	MAL11	P53048	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	YGR012W	P53206	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	ADY3	Q07732	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	TPO1	Q07824	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	SPE1	P08432	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	HSF1	P10961	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	PHO8	P11491	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	GCV2	P49095	1034 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	RIM8	P53179	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	VPS62	P53285	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	GPB1	Q08886	897 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	HMI1	Q12039	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THP2	YHR167W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	THI80	P35202	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	GDH3	P39708	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	GYP8	P43570	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	OSW7	P43611	510 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	ALG2	P43636	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	DNA2	P38859	1522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	EMC1	P25574	760 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	CDC20	P26309	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	SPT20	P50875	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	RNH70	P53331	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	STE13	P33894	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	EMC3	P36039	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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