RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C YPR196WQ06595 470 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C CDA1Q06702 301 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C AIM39Q08223 395 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C PFK1P16861 987 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C AGP1P25376 633 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C SBA1P28707 216 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C YKL151CP36059 337 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C GIC1P38785 314 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C MBP1P39678 833 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C CHA4P43634 648 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C RPC82P32349 654 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C CTF4Q01454 927 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C SVF1Q05515 481 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C PIN2Q12057 282 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C NPC2Q12408 173 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C PPH3P32345 308 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C MSS4P38994 779 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C EXG2P52911 562 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C TPO2P53283 614 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C YDR306CQ06640 478 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C KCS1Q12494 1050 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C PRI2P20457 528 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C VBA5P36172 582 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C YER158CP40095 573 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C SFB2P53953 876 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C KIN4Q01919 800 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C VPS16Q03308 798 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C SHE9Q04172 456 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C OPI10Q08202 246 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C ADE8P04161 214 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C AAR2P32357 355 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C URM1P40554 99 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C GYP7P48365 746 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C RAI1P53063 387 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C SLI1P53304 468 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C VPS30Q02948 557 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C ENB1Q08299 606 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C SED4P25365 1065 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C MRP8P35719 219 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C YKR078WP36158 585 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C NPP2P39997 493 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C NCS6P53088 359 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C TAD3Q9URQ3 322 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR056CYFR056C KAR4P25583 335 aa3.33□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C CHS7P38843 316 aa3.33□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C VAC8P39968 578 aa3.33□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
YFR056CYFR056C GUP2Q08929 609 aa3.33□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C YTA7P40340 1379 aa3.33□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C SCT1P32784 759 aa3.32□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C YKL069WP36088 180 aa3.32□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C YRO2P38079 344 aa3.32□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C PBY1P38254 753 aa3.32□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C UBA2P52488 636 aa3.32□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C PRP9P19736 530 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C RAD53P22216 821 aa3.31□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C RFA1P22336 621 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C SUL1P38359 859 aa3.31□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C TSL1P38427 1098 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C IRR1P40541 1150 aa3.31□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C IOC4Q04213 475 aa3.31□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C UPC2Q12151 913 aa3.31□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C STE13P33894 931 aa3.3□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C OAR1P35731 278 aa3.3□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C KTR4P38131 464 aa3.3□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C OCA5P38738 679 aa3.3□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C ALD6P54115 500 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C TDA5Q06417 326 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C PPM2Q08282 695 aa3.3□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C NPP1P25353 742 aa3.29□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C CDC11P32458 415 aa3.29□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C MOH1P38191 138 aa3.29□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C SIT1P39980 628 aa3.29□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C YLR040CQ07988 224 aa3.29□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C YOL073CQ08232 322 aa3.29□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C LAS17Q12446 633 aa3.29□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C ERG4P25340 473 aa3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C TYE7P33122 291 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C YIL108WP40483 696 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C CEP3P40969 608 aa3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C YKE2P52553 114 aa3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C TIM44Q01852 431 aa3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C PEX19Q07418 342 aa3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YFR056CYFR056C RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YFR056CYFR056C RPD3P32561 433 aa3.27□□□□□ -1.89
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