RNA–Protein interactions for RNA: YBL003C

HTA2, Transcript of Histone H2A, yeast

Gene HTA2, Length 399 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTA2	YBL003C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	RMP1	Q12530	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	RTP1	Q12751	981 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	YER152C	P10356	443 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	KCC4	P25389	1037 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	AFG2	P32794	780 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	REC104	P33323	182 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	PNT1	P38969	423 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	NEO1	P40527	1151 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	NIT2	P47016	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	SLD3	P53135	668 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	RRI2	Q12348	645 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TFA2	P36145	328 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	GCV1	P48015	400 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	NIT3	P49954	291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	ATP25	Q03153	612 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	ERP4	Q12450	207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	INH1	P01097	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	NFS1	P25374	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	HOG1	P32485	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	EMC3	P36039	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	BIT2	P38346	545 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	YAR028W	P39548	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	HIS6	P40545	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	SAP185	P40856	1058 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	PHM6	Q05637	104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	RSC3	Q06639	885 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	DPH6	Q12429	685 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	ENA1	P13587	1091 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	PHO81	P17442	1178 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	YHL041W	P38730	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TOK1	P40310	691 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	JJJ3	P47138	172 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	ATG33	Q06485	197 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	REH1	Q06709	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TRK2	P28584	889 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	DBF20	P32328	564 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	ACA1	P39970	489 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	SRB7	P47822	140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	YML131W	Q03102	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	SKY1	Q03656	742 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	OPY2	Q06810	360 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	MET7	Q08645	548 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	GUP2	Q08929	609 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	MCD4	P36051	919 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	EXO84	P38261	753 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	TDA3	P38758	523 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	YAP1801	P38856	637 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	GYP8	P43570	497 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	SPO74	P45819	413 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	IML2	P47031	731 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	YGR153W	P48238	217 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	NHX1	Q04121	633 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	ACM1	Q08981	209 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	SPO21	Q12411	609 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	TMA108	P40462	946 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	RET2	P43621	546 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	AIM14	P53109	570 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	PEX15	Q08215	383 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	KIP1	P28742	1111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HTA2	YBL003C	PRO1	P32264	428 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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