RNA–Protein interactions for RNA: YKL015W

PUT3, Transcript of Transcriptional activator, yeast

Gene PUT3, Length 2,940 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUT3	YKL015W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	GLO4	Q12320	285 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	NSI1	Q12457	570 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	AI3	P03877	415 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	PAN5	P38787	379 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	PES4	P39684	611 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	VAB2	P40003	282 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	YJR124C	P47159	448 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	GUP1	P53154	560 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	YNR065C	P53751	1116 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	GIN4	Q12263	1142 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	DAL5	P15365	543 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	TIM23	P32897	222 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	DUR3	P33413	735 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	AKR1	P39010	764 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	PSF2	P40359	213 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	LSB6	P42951	607 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SGD1	Q06132	899 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	OXR1	Q08952	273 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SQT1	P35184	431 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	OCT1	P35999	772 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	YHL050C	P38721	697 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	YHR219W	P38900	624 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SAM37	P50110	327 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	VPS4	P52917	437 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	VPS62	P53285	467 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	CDC55	Q00362	526 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	FLO11	P08640	1367 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SFA1	P32771	386 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	STV1	P37296	890 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SPL2	P38839	148 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	LYS14	P40971	790 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	PCL8	Q08966	492 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SWI1	P09547	1314 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	PEP7	P32609	515 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	LEM3	P42838	414 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	RSM26	P47141	266 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	FAR11	P53917	953 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	BSC2	Q05611	235 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	AVO1	Q08236	1176 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	AIM44	Q99299	758 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	RAD53	P22216	821 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SEC20	P28791	383 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SPO71	Q03868	1245 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	FLP1	P03870	423 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	POL3	P15436	1097 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	MGM1	P32266	881 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	YKL077W	P36081	392 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	PNT1	P38969	423 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	GYP7	P48365	746 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	DSE4	P53753	1117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	PIF1	P07271	859 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	RIM11	P38615	370 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	MSH6	Q03834	1242 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	YLL054C	Q12244	843 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	NPR1	P22211	790 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	LAM4	P38800	1345 aa		2.71	□□□□□ -1.97
PUT3	YKL015W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	COQ4	O13525	335 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	ERS1	P17261	260 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	POA1	P38218	177 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	SHU2	P38957	223 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	GPB2	P39717	880 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	YFH7	P43591	353 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	ZDS2	P54786	942 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	MET7	Q08645	548 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	ELG1	Q12050	791 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	CYB2	P00175	591 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	PRD1	P25375	712 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	LIP5	P32875	414 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	MGE1	P38523	228 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PUT3	YKL015W	NUT1	P53114	1132 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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