RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC2-216ENST00000523628 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 KLRG1Q96E93 195 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 MSTNO14793 375 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 MSX1P28360 303 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 ABL2P42684 1182 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 PGBD3Q8N328 593 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 RUBCNLQ9H714 662 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 SYNJ1O43426 1573 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 ITGB2P05107 769 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 EFHC2Q5JST6 749 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 GRIN2BQ13224 1484 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 SOGA1O94964 1423 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 RNF135Q8IUD6 432 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 SIRT1Q96EB6 747 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 RAD21O60216 631 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 TLR1Q15399 786 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 VAC14Q08AM6 782 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.24
HDAC2-216ENST00000523628 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 BNIP3LO60238 219 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 PROCP04070 461 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 BMP4P12644 408 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 FGFR3P22607 806 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 SYNJ2O15056 1496 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 CHD1O14646 1710 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF11O15085 1522 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 C2CD2LO14523 706 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 INHAP05111 366 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 PLA2G4AP47712 749 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 SCNN1DP51172 638 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 CTBSQ01459 385 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ARID3AQ99856 593 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 RRAGCQ9HB90 399 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM23O75077 832 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 GDF10P55107 478 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 GGA1Q9UJY5 639 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 TOP2BQ02880 1626 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 PBRM1Q86U86 1689 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 CUX1P39880 1505 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 KRBA1A5PL33 1030 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 WASHC4Q2M389 1173 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ATP4AP20648 1035 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 SMTNP53814 917 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 NLRP8Q86W28 1048 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ALG2Q9H553 416 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 ARAFP10398 606 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 AMPD1P23109 780 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 COL8A1P27658 744 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 SEMA3FQ13275 785 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC2-216ENST00000523628 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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