RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C PRX1P34227 261 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C SIS2P36024 562 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C APE3P37302 537 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C VRP1P37370 817 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C NDT80P38830 627 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C LYS14P40971 790 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C BUD6P41697 788 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-JR2P47099 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C ASE1P50275 885 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C YGL138CP53122 345 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C HST2P53686 357 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-DR1Q03856 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TMA64Q04600 565 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C DCS2Q12123 353 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-BRQ12217 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-NL2Q12470 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-GR2Q12485 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C CIT1P00890 479 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C BIK1P11709 440 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C SEC2P17065 759 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C GCD11P32481 527 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C IXR1P33417 597 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C ASH1P34233 588 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TTI1P36097 1038 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C MAL33P38157 468 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C RFC5P38251 354 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C BDH2P39713 417 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C VAB2P40003 282 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C YNL115CP53925 644 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C GDE1Q02979 1223 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C MMP1Q12372 583 aa6.53□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C HSP82P02829 709 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data6.52□□□□□ -1.37not detected
RRP4YHR069C ESS1P22696 170 aa6.52□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C RDS1P25611 832 aa6.52□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C CCT3P39077 534 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C DUS1P53759 423 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C ALD6P54115 500 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C GIS4Q04233 774 aa6.52□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C SAM1P10659 382 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C SLY41P22215 453 aa6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C UGA4P32837 571 aa6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C MCD4P36051 919 aa6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C VPS24P36095 224 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C ERG7P38604 731 aa6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C PAN5P38787 379 aa6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C DJP1P40564 432 aa6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C HYR1P40581 163 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C FMS1P50264 508 aa6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C DMA2P53924 522 aa6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C GET3Q12154 354 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C TIF6Q12522 245 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C PGI1P12709 554 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C ASF1P32447 279 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C UTR4P32626 227 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C BCK2P33306 851 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C CTR1P49573 406 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C YGL081WP53156 320 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C LSB1P53281 241 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C RET3P53600 189 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C HST1P53685 503 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C SPH1Q06160 661 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C CEX1Q12453 761 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C PTC5Q12511 572 aa6.5□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C VMA2P16140 517 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C YJU3P28321 313 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C SEC20P28791 383 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C SHP1P34223 423 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C RSC30P38781 883 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C GPB2P39717 880 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C TPM2P40414 161 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C SPR3P41901 512 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C CIR1P42940 261 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C NAF1P53919 492 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C PEX19Q07418 342 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C GUD1Q07729 489 aa6.49□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C FRS2P15625 503 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C PKC1P24583 1151 aa6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C URA1P28272 314 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C EUG1P32474 517 aa6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C ELM1P32801 640 aa6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C CIT3P43635 486 aa6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C PEX14P53112 341 aa6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C LIF1P53150 421 aa6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C PIL1P53252 339 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C SRF1Q12516 437 aa6.48□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C ECM29P38737 1868 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C MSP1P28737 362 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C MCR1P36060 302 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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