RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B4galnt4Q766D5 1034 aa15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rsph6aQ8CDR2 708 aa15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sos1Q62245 1319 aa15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 StrcQ8VIM6 1809 aa15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klrk1O54709 232 aa15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jmjd4Q8BFT6 427 aa15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ClspnQ80YR7 1315 aa15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim28Q62318 834 aa15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TrhQ62361 256 aa15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc12a5Q91V14 1138 aa15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssfa2Q922B9 1252 aa15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Golgb1E9PVZ8 3238 aa15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spef2Q8C9J3 1734 aa15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snap23O09044 210 aa15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plekhg5Q66T02 1073 aa15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tktl2Q9D4D4 627 aa15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aox2Q5SGK3 1345 aa15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chmp7Q8R1T1 451 aa15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P2rx7Q9Z1M0 595 aa15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Syde2E9PUP1 1314 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpm3Q5F4S9 1721 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r15aP17564 657 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Amhr2Q8K592 568 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col4a5Q63ZW6 1691 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Megf6Q80V70 1572 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SnrkQ8VDU5 748 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Podxl2Q8CAE9 603 aa15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TnikP83510 1323 aa15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 VwdeQ6DFV8 926 aa15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf428Q8C1M2 176 aa15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HypkQ9CR41 129 aa15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trip6Q9Z1Y4 480 aa15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kndc1Q0KK55 1742 aa15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 WasP70315 520 aa15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NogP97466 232 aa15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IarsQ8BU30 1262 aa15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Amotl1Q9D4H4 968 aa15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Strn4P58404 760 aa15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp1b3P97370 278 aa15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8C6G1 249 aa15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Efcab2Q9CQ46 164 aa15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cfap70D3YVL2 1141 aa15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gja5Q01231 358 aa15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc43Q3V0L5 667 aa15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PigbQ9JJQ0 542 aa15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PalmQ9Z0P4 383 aa15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col4a1P02463 1669 aa15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PgfP49764 158 aa15.08■□□□□ 0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb1Q91VL9 713 aa15.08■□□□□ 0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AceP09470 1312 aa15.08■□□□□ 0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gjd4Q8BSD4 364 aa15.07■□□□□ 0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa15.07■□□□□ 0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itgb4A2A863 1818 aa15.07■□□□□ 0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atf5O70191 283 aa15.06■□□□□ 0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa15.06■□□□□ 0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ric1Q69ZJ7 1422 aa15.04■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 XpcP51612 930 aa15.04■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SobpQ0P5V2 864 aa15.04■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Irx6Q9ER75 438 aa15.04■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa15.03■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gja3Q64448 417 aa15.03■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spire2Q8K1S6 718 aa15.03■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhdc4Q921I2 584 aa15.03■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa15.02■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp777B9EKF4 885 aa15.02■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdhd1P59328 1117 aa15.02■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ciapin1Q8WTY4 309 aa15.02■□□□□ -0
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nav1Q8CH77 1875 aa15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubn2Q80WC1 1314 aa15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa15□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cabp2Q9JLK4 216 aa15□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd248Q91V98 765 aa14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PdgfdQ925I7 370 aa14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CfhP06909 1234 aa14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pde4dQ01063 747 aa14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrimpolQ6P1E7 537 aa14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tango6Q8C3S2 1079 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.9 ms