Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.23■■■■■ 5.47
Itgb4A2A863 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
Itgb4A2A863 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Itgb4A2A863 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Itgb4A2A863 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
Itgb4A2A863 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
Itgb4A2A863 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Itgb4A2A863 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Itgb4A2A863 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Itgb4A2A863 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Itgb4A2A863 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
Itgb4A2A863 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Itgb4A2A863 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Itgb4A2A863 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Itgb4A2A863 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Itgb4A2A863 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Itgb4A2A863 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Itgb4A2A863 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Itgb4A2A863 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Itgb4A2A863 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Itgb4A2A863 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Itgb4A2A863 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Itgb4A2A863 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Itgb4A2A863 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Itgb4A2A863 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Itgb4A2A863 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Itgb4A2A863 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Itgb4A2A863 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Itgb4A2A863 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Itgb4A2A863 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Itgb4A2A863 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Itgb4A2A863 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Itgb4A2A863 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Itgb4A2A863 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Itgb4A2A863 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Itgb4A2A863 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Itgb4A2A863 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Itgb4A2A863 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Itgb4A2A863 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Itgb4A2A863 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Itgb4A2A863 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Itgb4A2A863 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Itgb4A2A863 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Itgb4A2A863 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Itgb4A2A863 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Itgb4A2A863 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Itgb4A2A863 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Itgb4A2A863 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Itgb4A2A863 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Itgb4A2A863 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Itgb4A2A863 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Itgb4A2A863 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Itgb4A2A863 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Itgb4A2A863 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Itgb4A2A863 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Itgb4A2A863 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Itgb4A2A863 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Itgb4A2A863 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Itgb4A2A863 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Itgb4A2A863 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Itgb4A2A863 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Itgb4A2A863 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Itgb4A2A863 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Itgb4A2A863 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Itgb4A2A863 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Itgb4A2A863 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Itgb4A2A863 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Itgb4A2A863 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Itgb4A2A863 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Itgb4A2A863 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Itgb4A2A863 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Itgb4A2A863 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Itgb4A2A863 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Itgb4A2A863 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Itgb4A2A863 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Itgb4A2A863 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Itgb4A2A863 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Itgb4A2A863 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Itgb4A2A863 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Itgb4A2A863 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Itgb4A2A863 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Itgb4A2A863 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Itgb4A2A863 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Itgb4A2A863 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Itgb4A2A863 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Itgb4A2A863 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Itgb4A2A863 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Itgb4A2A863 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Itgb4A2A863 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Itgb4A2A863 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Itgb4A2A863 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Itgb4A2A863 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Itgb4A2A863 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Itgb4A2A863 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Itgb4A2A863 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Itgb4A2A863 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Itgb4A2A863 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Itgb4A2A863 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Itgb4A2A863 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Itgb4A2A863 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms