Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.56■■■■■ 5.52
Strn4P58404 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Strn4P58404 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Strn4P58404 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
Strn4P58404 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
Strn4P58404 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
Strn4P58404 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Strn4P58404 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Strn4P58404 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Strn4P58404 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Strn4P58404 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Strn4P58404 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Strn4P58404 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Strn4P58404 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Strn4P58404 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Strn4P58404 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
Strn4P58404 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Strn4P58404 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Strn4P58404 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Strn4P58404 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Strn4P58404 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Strn4P58404 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Strn4P58404 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Strn4P58404 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Strn4P58404 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Strn4P58404 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Strn4P58404 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Strn4P58404 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Strn4P58404 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Strn4P58404 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Strn4P58404 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Strn4P58404 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Strn4P58404 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Strn4P58404 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Strn4P58404 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Strn4P58404 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Strn4P58404 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Strn4P58404 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Strn4P58404 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Strn4P58404 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Strn4P58404 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Strn4P58404 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Strn4P58404 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Strn4P58404 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Strn4P58404 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Strn4P58404 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Strn4P58404 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Strn4P58404 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Strn4P58404 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Strn4P58404 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Strn4P58404 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Strn4P58404 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Strn4P58404 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Strn4P58404 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Strn4P58404 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Strn4P58404 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Strn4P58404 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Strn4P58404 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Strn4P58404 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Strn4P58404 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Strn4P58404 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Strn4P58404 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Strn4P58404 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Strn4P58404 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Strn4P58404 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Strn4P58404 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Strn4P58404 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Strn4P58404 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Strn4P58404 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Strn4P58404 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Strn4P58404 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Strn4P58404 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Strn4P58404 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Strn4P58404 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Strn4P58404 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Strn4P58404 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Strn4P58404 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Strn4P58404 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Strn4P58404 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Strn4P58404 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Strn4P58404 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Strn4P58404 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Strn4P58404 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Strn4P58404 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Strn4P58404 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Strn4P58404 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Strn4P58404 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Strn4P58404 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Strn4P58404 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Strn4P58404 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Strn4P58404 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Strn4P58404 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Strn4P58404 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Strn4P58404 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Strn4P58404 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Strn4P58404 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Strn4P58404 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Strn4P58404 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Strn4P58404 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Strn4P58404 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms