Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H4

Amotl1, Angiomotin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amotl1Q9D4H4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.62■■■■■ 5.69
Amotl1Q9D4H4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
Amotl1Q9D4H4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Amotl1Q9D4H4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
Amotl1Q9D4H4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
Amotl1Q9D4H4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
Amotl1Q9D4H4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Amotl1Q9D4H4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Amotl1Q9D4H4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Amotl1Q9D4H4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Amotl1Q9D4H4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Amotl1Q9D4H4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
Amotl1Q9D4H4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Amotl1Q9D4H4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Amotl1Q9D4H4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Amotl1Q9D4H4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Amotl1Q9D4H4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
Amotl1Q9D4H4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Amotl1Q9D4H4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
Amotl1Q9D4H4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Amotl1Q9D4H4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Amotl1Q9D4H4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Amotl1Q9D4H4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Amotl1Q9D4H4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Amotl1Q9D4H4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Amotl1Q9D4H4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Amotl1Q9D4H4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Amotl1Q9D4H4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Amotl1Q9D4H4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Amotl1Q9D4H4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Amotl1Q9D4H4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.02■■■■■ 4
Amotl1Q9D4H4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
Amotl1Q9D4H4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Amotl1Q9D4H4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Amotl1Q9D4H4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Amotl1Q9D4H4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Amotl1Q9D4H4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Amotl1Q9D4H4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Amotl1Q9D4H4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Amotl1Q9D4H4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Amotl1Q9D4H4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Amotl1Q9D4H4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Amotl1Q9D4H4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Amotl1Q9D4H4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Amotl1Q9D4H4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Amotl1Q9D4H4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Amotl1Q9D4H4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Amotl1Q9D4H4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Amotl1Q9D4H4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Amotl1Q9D4H4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Amotl1Q9D4H4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Amotl1Q9D4H4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Amotl1Q9D4H4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Amotl1Q9D4H4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Amotl1Q9D4H4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Amotl1Q9D4H4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Amotl1Q9D4H4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Amotl1Q9D4H4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Amotl1Q9D4H4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Amotl1Q9D4H4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Amotl1Q9D4H4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Amotl1Q9D4H4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Amotl1Q9D4H4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Amotl1Q9D4H4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Amotl1Q9D4H4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Amotl1Q9D4H4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Amotl1Q9D4H4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Amotl1Q9D4H4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Amotl1Q9D4H4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Amotl1Q9D4H4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Amotl1Q9D4H4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Amotl1Q9D4H4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Amotl1Q9D4H4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Amotl1Q9D4H4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Amotl1Q9D4H4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Amotl1Q9D4H4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Amotl1Q9D4H4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Amotl1Q9D4H4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Amotl1Q9D4H4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Amotl1Q9D4H4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Amotl1Q9D4H4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Amotl1Q9D4H4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Amotl1Q9D4H4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Amotl1Q9D4H4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Amotl1Q9D4H4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Amotl1Q9D4H4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Amotl1Q9D4H4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Amotl1Q9D4H4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Amotl1Q9D4H4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Amotl1Q9D4H4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Amotl1Q9D4H4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Amotl1Q9D4H4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Amotl1Q9D4H4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Amotl1Q9D4H4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Amotl1Q9D4H4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Amotl1Q9D4H4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Amotl1Q9D4H4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Amotl1Q9D4H4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Amotl1Q9D4H4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Amotl1Q9D4H4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms