Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,84■■■■■ 5,41
Gjd4Q8BSD4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,53■■■■■ 4,88
Gjd4Q8BSD4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,75■■■■■ 4,75
Gjd4Q8BSD4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,71■■■■■ 4,43
Gjd4Q8BSD4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,94■■■■■ 4,3
Gjd4Q8BSD4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Gjd4Q8BSD4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Gjd4Q8BSD4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Gjd4Q8BSD4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,9■■■■■ 4,14
Gjd4Q8BSD4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Gjd4Q8BSD4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,66■■■■■ 4,1
Gjd4Q8BSD4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,11■■■■■ 4,01
Gjd4Q8BSD4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,74■■■■□ 3,95
Gjd4Q8BSD4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
Gjd4Q8BSD4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,66■■■■□ 3,94
Gjd4Q8BSD4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Gjd4Q8BSD4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Gjd4Q8BSD4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Gjd4Q8BSD4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Gjd4Q8BSD4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,82■■■■□ 3,8
Gjd4Q8BSD4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,81■■■■□ 3,8
Gjd4Q8BSD4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Gjd4Q8BSD4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Gjd4Q8BSD4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,95■■■■□ 3,67
Gjd4Q8BSD4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Gjd4Q8BSD4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Gjd4Q8BSD4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Gjd4Q8BSD4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,71■■■■□ 3,63
Gjd4Q8BSD4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,52■■■■□ 3,6
Gjd4Q8BSD4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Gjd4Q8BSD4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,4■■■■□ 3,58
Gjd4Q8BSD4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37,32■■■■□ 3,56
Gjd4Q8BSD4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Gjd4Q8BSD4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,13■■■■□ 3,54
Gjd4Q8BSD4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Gjd4Q8BSD4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,98■■■■□ 3,51
Gjd4Q8BSD4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Gjd4Q8BSD4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Gjd4Q8BSD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Gjd4Q8BSD4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Gjd4Q8BSD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,92■■■■□ 3,5
Gjd4Q8BSD4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36,88■■■■□ 3,49
Gjd4Q8BSD4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,82■■■■□ 3,48
Gjd4Q8BSD4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Gjd4Q8BSD4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Gjd4Q8BSD4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Gjd4Q8BSD4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Gjd4Q8BSD4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,61■■■■□ 3,45
Gjd4Q8BSD4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,58■■■■□ 3,45
Gjd4Q8BSD4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Gjd4Q8BSD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Gjd4Q8BSD4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Gjd4Q8BSD4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Gjd4Q8BSD4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Gjd4Q8BSD4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Gjd4Q8BSD4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Gjd4Q8BSD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Gjd4Q8BSD4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Gjd4Q8BSD4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Gjd4Q8BSD4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Gjd4Q8BSD4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Gjd4Q8BSD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Gjd4Q8BSD4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Gjd4Q8BSD4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Gjd4Q8BSD4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Gjd4Q8BSD4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Gjd4Q8BSD4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,57■■■■□ 3,29
Gjd4Q8BSD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Gjd4Q8BSD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Gjd4Q8BSD4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Gjd4Q8BSD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Gjd4Q8BSD4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Gjd4Q8BSD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
Gjd4Q8BSD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
Gjd4Q8BSD4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Gjd4Q8BSD4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,28■■■■□ 3,24
Gjd4Q8BSD4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Gjd4Q8BSD4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Gjd4Q8BSD4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Gjd4Q8BSD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Gjd4Q8BSD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Gjd4Q8BSD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Gjd4Q8BSD4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Gjd4Q8BSD4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Gjd4Q8BSD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Gjd4Q8BSD4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Gjd4Q8BSD4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Gjd4Q8BSD4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Gjd4Q8BSD4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Gjd4Q8BSD4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,75■■■■□ 3,15
Gjd4Q8BSD4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Gjd4Q8BSD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Gjd4Q8BSD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Gjd4Q8BSD4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Gjd4Q8BSD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Gjd4Q8BSD4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Gjd4Q8BSD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Gjd4Q8BSD4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,67■■■■□ 3,14
Gjd4Q8BSD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Gjd4Q8BSD4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,6 ms