Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.84■■■■■ 5.41
Gjd4Q8BSD4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Gjd4Q8BSD4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Gjd4Q8BSD4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
Gjd4Q8BSD4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Gjd4Q8BSD4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Gjd4Q8BSD4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Gjd4Q8BSD4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Gjd4Q8BSD4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
Gjd4Q8BSD4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Gjd4Q8BSD4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Gjd4Q8BSD4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Gjd4Q8BSD4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Gjd4Q8BSD4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Gjd4Q8BSD4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Gjd4Q8BSD4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Gjd4Q8BSD4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Gjd4Q8BSD4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Gjd4Q8BSD4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Gjd4Q8BSD4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Gjd4Q8BSD4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Gjd4Q8BSD4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Gjd4Q8BSD4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Gjd4Q8BSD4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Gjd4Q8BSD4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Gjd4Q8BSD4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Gjd4Q8BSD4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Gjd4Q8BSD4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gjd4Q8BSD4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Gjd4Q8BSD4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Gjd4Q8BSD4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Gjd4Q8BSD4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Gjd4Q8BSD4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Gjd4Q8BSD4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
Gjd4Q8BSD4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Gjd4Q8BSD4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Gjd4Q8BSD4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Gjd4Q8BSD4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Gjd4Q8BSD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Gjd4Q8BSD4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Gjd4Q8BSD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Gjd4Q8BSD4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Gjd4Q8BSD4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Gjd4Q8BSD4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Gjd4Q8BSD4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Gjd4Q8BSD4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Gjd4Q8BSD4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Gjd4Q8BSD4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Gjd4Q8BSD4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Gjd4Q8BSD4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Gjd4Q8BSD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Gjd4Q8BSD4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Gjd4Q8BSD4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gjd4Q8BSD4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Gjd4Q8BSD4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Gjd4Q8BSD4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gjd4Q8BSD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gjd4Q8BSD4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Gjd4Q8BSD4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Gjd4Q8BSD4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Gjd4Q8BSD4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Gjd4Q8BSD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Gjd4Q8BSD4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Gjd4Q8BSD4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gjd4Q8BSD4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gjd4Q8BSD4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gjd4Q8BSD4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Gjd4Q8BSD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Gjd4Q8BSD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gjd4Q8BSD4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Gjd4Q8BSD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gjd4Q8BSD4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Gjd4Q8BSD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Gjd4Q8BSD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Gjd4Q8BSD4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Gjd4Q8BSD4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Gjd4Q8BSD4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Gjd4Q8BSD4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Gjd4Q8BSD4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Gjd4Q8BSD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gjd4Q8BSD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gjd4Q8BSD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Gjd4Q8BSD4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gjd4Q8BSD4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gjd4Q8BSD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gjd4Q8BSD4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gjd4Q8BSD4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gjd4Q8BSD4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Gjd4Q8BSD4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Gjd4Q8BSD4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gjd4Q8BSD4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gjd4Q8BSD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gjd4Q8BSD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gjd4Q8BSD4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gjd4Q8BSD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gjd4Q8BSD4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gjd4Q8BSD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Gjd4Q8BSD4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Gjd4Q8BSD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Gjd4Q8BSD4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms