Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.83■■■■■ 5.41
Atf5O70191 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Atf5O70191 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Atf5O70191 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Atf5O70191 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
Atf5O70191 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
Atf5O70191 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Atf5O70191 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
Atf5O70191 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Atf5O70191 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Atf5O70191 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Atf5O70191 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Atf5O70191 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Atf5O70191 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Atf5O70191 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Atf5O70191 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Atf5O70191 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Atf5O70191 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Atf5O70191 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Atf5O70191 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Atf5O70191 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Atf5O70191 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Atf5O70191 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Atf5O70191 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Atf5O70191 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Atf5O70191 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Atf5O70191 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Atf5O70191 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Atf5O70191 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Atf5O70191 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Atf5O70191 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Atf5O70191 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Atf5O70191 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Atf5O70191 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Atf5O70191 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Atf5O70191 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Atf5O70191 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Atf5O70191 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Atf5O70191 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Atf5O70191 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Atf5O70191 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Atf5O70191 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Atf5O70191 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Atf5O70191 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Atf5O70191 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Atf5O70191 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Atf5O70191 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Atf5O70191 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Atf5O70191 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Atf5O70191 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Atf5O70191 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Atf5O70191 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Atf5O70191 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Atf5O70191 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Atf5O70191 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Atf5O70191 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Atf5O70191 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Atf5O70191 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Atf5O70191 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Atf5O70191 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atf5O70191 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Atf5O70191 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Atf5O70191 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Atf5O70191 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Atf5O70191 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Atf5O70191 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Atf5O70191 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Atf5O70191 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Atf5O70191 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Atf5O70191 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Atf5O70191 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Atf5O70191 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Atf5O70191 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Atf5O70191 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Atf5O70191 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Atf5O70191 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Atf5O70191 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Atf5O70191 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Atf5O70191 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Atf5O70191 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Atf5O70191 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Atf5O70191 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Atf5O70191 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Atf5O70191 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Atf5O70191 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Atf5O70191 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Atf5O70191 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Atf5O70191 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Atf5O70191 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Atf5O70191 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Atf5O70191 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atf5O70191 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Atf5O70191 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Atf5O70191 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Atf5O70191 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Atf5O70191 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Atf5O70191 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Atf5O70191 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Atf5O70191 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Atf5O70191 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms