Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR41

Hypk, Huntingtin-interacting protein K, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypkQ9CR41 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.66■■■■■ 5.7
HypkQ9CR41 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
HypkQ9CR41 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
HypkQ9CR41 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
HypkQ9CR41 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
HypkQ9CR41 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
HypkQ9CR41 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
HypkQ9CR41 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HypkQ9CR41 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
HypkQ9CR41 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
HypkQ9CR41 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
HypkQ9CR41 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
HypkQ9CR41 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
HypkQ9CR41 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
HypkQ9CR41 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
HypkQ9CR41 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
HypkQ9CR41 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
HypkQ9CR41 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
HypkQ9CR41 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
HypkQ9CR41 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
HypkQ9CR41 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
HypkQ9CR41 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
HypkQ9CR41 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
HypkQ9CR41 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
HypkQ9CR41 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
HypkQ9CR41 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
HypkQ9CR41 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
HypkQ9CR41 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
HypkQ9CR41 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HypkQ9CR41 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
HypkQ9CR41 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
HypkQ9CR41 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
HypkQ9CR41 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40■■■■□ 3.99
HypkQ9CR41 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
HypkQ9CR41 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
HypkQ9CR41 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HypkQ9CR41 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
HypkQ9CR41 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
HypkQ9CR41 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
HypkQ9CR41 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
HypkQ9CR41 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
HypkQ9CR41 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HypkQ9CR41 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
HypkQ9CR41 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HypkQ9CR41 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
HypkQ9CR41 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
HypkQ9CR41 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
HypkQ9CR41 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
HypkQ9CR41 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HypkQ9CR41 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
HypkQ9CR41 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
HypkQ9CR41 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HypkQ9CR41 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HypkQ9CR41 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
HypkQ9CR41 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
HypkQ9CR41 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HypkQ9CR41 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HypkQ9CR41 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HypkQ9CR41 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
HypkQ9CR41 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
HypkQ9CR41 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HypkQ9CR41 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HypkQ9CR41 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HypkQ9CR41 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
HypkQ9CR41 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HypkQ9CR41 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HypkQ9CR41 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HypkQ9CR41 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
HypkQ9CR41 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
HypkQ9CR41 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HypkQ9CR41 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HypkQ9CR41 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HypkQ9CR41 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
HypkQ9CR41 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HypkQ9CR41 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
HypkQ9CR41 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
HypkQ9CR41 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
HypkQ9CR41 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
HypkQ9CR41 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HypkQ9CR41 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
HypkQ9CR41 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HypkQ9CR41 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HypkQ9CR41 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HypkQ9CR41 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
HypkQ9CR41 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
HypkQ9CR41 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
HypkQ9CR41 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HypkQ9CR41 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HypkQ9CR41 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HypkQ9CR41 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HypkQ9CR41 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
HypkQ9CR41 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HypkQ9CR41 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
HypkQ9CR41 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
HypkQ9CR41 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
HypkQ9CR41 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
HypkQ9CR41 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HypkQ9CR41 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
HypkQ9CR41 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
HypkQ9CR41 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms