Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0X4

Pde3a, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3aQ9Z0X4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.19■■■■■ 5.47
Pde3aQ9Z0X4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Pde3aQ9Z0X4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Pde3aQ9Z0X4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
Pde3aQ9Z0X4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Pde3aQ9Z0X4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Pde3aQ9Z0X4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Pde3aQ9Z0X4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Pde3aQ9Z0X4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
Pde3aQ9Z0X4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
Pde3aQ9Z0X4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Pde3aQ9Z0X4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Pde3aQ9Z0X4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Pde3aQ9Z0X4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Pde3aQ9Z0X4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Pde3aQ9Z0X4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Pde3aQ9Z0X4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Pde3aQ9Z0X4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Pde3aQ9Z0X4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Pde3aQ9Z0X4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Pde3aQ9Z0X4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Pde3aQ9Z0X4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Pde3aQ9Z0X4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Pde3aQ9Z0X4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Pde3aQ9Z0X4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Pde3aQ9Z0X4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Pde3aQ9Z0X4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Pde3aQ9Z0X4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Pde3aQ9Z0X4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Pde3aQ9Z0X4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Pde3aQ9Z0X4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Pde3aQ9Z0X4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Pde3aQ9Z0X4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Pde3aQ9Z0X4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Pde3aQ9Z0X4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Pde3aQ9Z0X4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Pde3aQ9Z0X4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Pde3aQ9Z0X4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Pde3aQ9Z0X4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Pde3aQ9Z0X4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Pde3aQ9Z0X4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Pde3aQ9Z0X4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Pde3aQ9Z0X4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Pde3aQ9Z0X4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pde3aQ9Z0X4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pde3aQ9Z0X4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pde3aQ9Z0X4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pde3aQ9Z0X4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pde3aQ9Z0X4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Pde3aQ9Z0X4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Pde3aQ9Z0X4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Pde3aQ9Z0X4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pde3aQ9Z0X4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pde3aQ9Z0X4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pde3aQ9Z0X4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Pde3aQ9Z0X4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Pde3aQ9Z0X4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pde3aQ9Z0X4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pde3aQ9Z0X4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pde3aQ9Z0X4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pde3aQ9Z0X4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pde3aQ9Z0X4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pde3aQ9Z0X4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pde3aQ9Z0X4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pde3aQ9Z0X4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pde3aQ9Z0X4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Pde3aQ9Z0X4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pde3aQ9Z0X4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Pde3aQ9Z0X4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pde3aQ9Z0X4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pde3aQ9Z0X4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pde3aQ9Z0X4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pde3aQ9Z0X4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pde3aQ9Z0X4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pde3aQ9Z0X4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pde3aQ9Z0X4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pde3aQ9Z0X4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Pde3aQ9Z0X4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Pde3aQ9Z0X4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pde3aQ9Z0X4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pde3aQ9Z0X4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pde3aQ9Z0X4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pde3aQ9Z0X4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pde3aQ9Z0X4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pde3aQ9Z0X4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pde3aQ9Z0X4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pde3aQ9Z0X4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pde3aQ9Z0X4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Pde3aQ9Z0X4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pde3aQ9Z0X4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pde3aQ9Z0X4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pde3aQ9Z0X4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pde3aQ9Z0X4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pde3aQ9Z0X4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pde3aQ9Z0X4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pde3aQ9Z0X4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pde3aQ9Z0X4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pde3aQ9Z0X4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pde3aQ9Z0X4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Pde3aQ9Z0X4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms