Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.21■■■■■ 5.47
Klhdc4Q921I2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Klhdc4Q921I2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Klhdc4Q921I2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Klhdc4Q921I2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
Klhdc4Q921I2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
Klhdc4Q921I2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Klhdc4Q921I2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
Klhdc4Q921I2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Klhdc4Q921I2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Klhdc4Q921I2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Klhdc4Q921I2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Klhdc4Q921I2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Klhdc4Q921I2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Klhdc4Q921I2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Klhdc4Q921I2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Klhdc4Q921I2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
Klhdc4Q921I2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Klhdc4Q921I2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Klhdc4Q921I2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Klhdc4Q921I2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Klhdc4Q921I2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Klhdc4Q921I2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Klhdc4Q921I2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Klhdc4Q921I2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Klhdc4Q921I2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Klhdc4Q921I2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Klhdc4Q921I2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Klhdc4Q921I2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Klhdc4Q921I2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Klhdc4Q921I2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Klhdc4Q921I2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Klhdc4Q921I2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Klhdc4Q921I2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Klhdc4Q921I2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Klhdc4Q921I2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Klhdc4Q921I2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Klhdc4Q921I2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Klhdc4Q921I2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Klhdc4Q921I2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Klhdc4Q921I2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Klhdc4Q921I2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Klhdc4Q921I2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Klhdc4Q921I2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Klhdc4Q921I2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Klhdc4Q921I2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Klhdc4Q921I2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Klhdc4Q921I2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Klhdc4Q921I2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Klhdc4Q921I2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Klhdc4Q921I2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Klhdc4Q921I2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Klhdc4Q921I2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Klhdc4Q921I2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Klhdc4Q921I2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Klhdc4Q921I2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Klhdc4Q921I2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Klhdc4Q921I2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Klhdc4Q921I2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Klhdc4Q921I2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Klhdc4Q921I2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Klhdc4Q921I2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Klhdc4Q921I2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Klhdc4Q921I2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Klhdc4Q921I2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Klhdc4Q921I2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Klhdc4Q921I2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Klhdc4Q921I2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Klhdc4Q921I2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Klhdc4Q921I2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Klhdc4Q921I2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Klhdc4Q921I2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Klhdc4Q921I2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Klhdc4Q921I2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Klhdc4Q921I2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Klhdc4Q921I2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Klhdc4Q921I2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Klhdc4Q921I2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Klhdc4Q921I2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Klhdc4Q921I2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Klhdc4Q921I2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Klhdc4Q921I2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Klhdc4Q921I2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Klhdc4Q921I2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Klhdc4Q921I2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Klhdc4Q921I2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Klhdc4Q921I2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Klhdc4Q921I2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Klhdc4Q921I2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Klhdc4Q921I2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Klhdc4Q921I2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Klhdc4Q921I2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Klhdc4Q921I2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Klhdc4Q921I2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Klhdc4Q921I2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Klhdc4Q921I2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Klhdc4Q921I2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Klhdc4Q921I2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Klhdc4Q921I2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Klhdc4Q921I2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms