Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49,21■■■■■ 5,47
Klhdc4Q921I2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,67■■■■■ 4,9
Klhdc4Q921I2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,03■■■■■ 4,8
Klhdc4Q921I2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
Klhdc4Q921I2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,1■■■■■ 4,49
Klhdc4Q921I2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,87■■■■■ 4,45
Klhdc4Q921I2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,45■■■■■ 4,39
Klhdc4Q921I2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,28■■■■■ 4,36
Klhdc4Q921I2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,91■■■■■ 4,3
Klhdc4Q921I2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,67■■■■■ 4,26
Klhdc4Q921I2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Klhdc4Q921I2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Klhdc4Q921I2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41,01■■■■■ 4,16
Klhdc4Q921I2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Klhdc4Q921I2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Klhdc4Q921I2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,41■■■■■ 4,06
Klhdc4Q921I2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,23■■■■■ 4,03
Klhdc4Q921I2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
Klhdc4Q921I2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,1■■■■■ 4,01
Klhdc4Q921I2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,09■■■■■ 4,01
Klhdc4Q921I2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■□ 3,99
Klhdc4Q921I2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,94■■■■□ 3,98
Klhdc4Q921I2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
Klhdc4Q921I2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
Klhdc4Q921I2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,84■■■■□ 3,97
Klhdc4Q921I2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Klhdc4Q921I2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
Klhdc4Q921I2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Klhdc4Q921I2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,72■■■■□ 3,95
Klhdc4Q921I2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,7■■■■□ 3,95
Klhdc4Q921I2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Klhdc4Q921I2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,46■■■■□ 3,91
Klhdc4Q921I2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Klhdc4Q921I2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39,1■■■■□ 3,85
Klhdc4Q921I2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
Klhdc4Q921I2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Klhdc4Q921I2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,9■■■■□ 3,82
Klhdc4Q921I2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Klhdc4Q921I2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Klhdc4Q921I2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Klhdc4Q921I2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Klhdc4Q921I2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Klhdc4Q921I2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,19■■■■□ 3,7
Klhdc4Q921I2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Klhdc4Q921I2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Klhdc4Q921I2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Klhdc4Q921I2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Klhdc4Q921I2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,98■■■■□ 3,67
Klhdc4Q921I2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,97■■■■□ 3,67
Klhdc4Q921I2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Klhdc4Q921I2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,92■■■■□ 3,66
Klhdc4Q921I2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37,89■■■■□ 3,66
Klhdc4Q921I2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Klhdc4Q921I2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37,82■■■■□ 3,64
Klhdc4Q921I2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,77■■■■□ 3,64
Klhdc4Q921I2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Klhdc4Q921I2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Klhdc4Q921I2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Klhdc4Q921I2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Klhdc4Q921I2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Klhdc4Q921I2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,41■■■■□ 3,58
Klhdc4Q921I2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Klhdc4Q921I2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Klhdc4Q921I2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37,28■■■■□ 3,56
Klhdc4Q921I2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Klhdc4Q921I2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Klhdc4Q921I2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Klhdc4Q921I2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Klhdc4Q921I2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
Klhdc4Q921I2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Klhdc4Q921I2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
Klhdc4Q921I2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Klhdc4Q921I2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Klhdc4Q921I2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Klhdc4Q921I2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Klhdc4Q921I2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Klhdc4Q921I2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Klhdc4Q921I2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Klhdc4Q921I2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,98■■■■□ 3,51
Klhdc4Q921I2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Klhdc4Q921I2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,87■■■■□ 3,49
Klhdc4Q921I2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Klhdc4Q921I2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Klhdc4Q921I2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,82■■■■□ 3,48
Klhdc4Q921I2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,79■■■■□ 3,48
Klhdc4Q921I2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,77■■■■□ 3,48
Klhdc4Q921I2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Klhdc4Q921I2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,76■■■■□ 3,48
Klhdc4Q921I2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Klhdc4Q921I2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,7■■■■□ 3,47
Klhdc4Q921I2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,68■■■■□ 3,46
Klhdc4Q921I2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Klhdc4Q921I2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Klhdc4Q921I2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Klhdc4Q921I2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Klhdc4Q921I2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Klhdc4Q921I2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Klhdc4Q921I2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Klhdc4Q921I2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Klhdc4Q921I2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms