Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49,66■■■■■ 5,54
Irx6Q9ER75 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,99■■■■■ 4,95
Irx6Q9ER75 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,27■■■■■ 4,84
Irx6Q9ER75 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,3■■■■■ 4,52
Irx6Q9ER75 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43,08■■■■■ 4,49
Irx6Q9ER75 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Irx6Q9ER75 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,3■■■■■ 4,36
Irx6Q9ER75 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,33
Irx6Q9ER75 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,85■■■■■ 4,29
Irx6Q9ER75 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Irx6Q9ER75 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,66■■■■■ 4,26
Irx6Q9ER75 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41,41■■■■■ 4,22
Irx6Q9ER75 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Irx6Q9ER75 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,11■■■■■ 4,17
Irx6Q9ER75 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Irx6Q9ER75 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Irx6Q9ER75 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,27■■■■■ 4,04
Irx6Q9ER75 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,02■■■■■ 4
Irx6Q9ER75 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3,99
Irx6Q9ER75 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Irx6Q9ER75 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,95■■■■□ 3,99
Irx6Q9ER75 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,97
Irx6Q9ER75 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,78■■■■□ 3,96
Irx6Q9ER75 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Irx6Q9ER75 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Irx6Q9ER75 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Irx6Q9ER75 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Irx6Q9ER75 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Irx6Q9ER75 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Irx6Q9ER75 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Irx6Q9ER75 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39,23■■■■□ 3,87
Irx6Q9ER75 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Irx6Q9ER75 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Irx6Q9ER75 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,13■■■■□ 3,85
Irx6Q9ER75 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39,12■■■■□ 3,85
Irx6Q9ER75 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,06■■■■□ 3,84
Irx6Q9ER75 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Irx6Q9ER75 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,38■■■■□ 3,73
Irx6Q9ER75 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,26■■■■□ 3,72
Irx6Q9ER75 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Irx6Q9ER75 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
Irx6Q9ER75 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Irx6Q9ER75 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38,16■■■■□ 3,7
Irx6Q9ER75 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Irx6Q9ER75 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Irx6Q9ER75 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Irx6Q9ER75 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37,89■■■■□ 3,66
Irx6Q9ER75 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Irx6Q9ER75 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,73■■■■□ 3,63
Irx6Q9ER75 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Irx6Q9ER75 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,61
Irx6Q9ER75 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Irx6Q9ER75 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,58■■■■□ 3,61
Irx6Q9ER75 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,57■■■■□ 3,6
Irx6Q9ER75 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Irx6Q9ER75 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,41■■■■□ 3,58
Irx6Q9ER75 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Irx6Q9ER75 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Irx6Q9ER75 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Irx6Q9ER75 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37,23■■■■□ 3,55
Irx6Q9ER75 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37,15■■■■□ 3,54
Irx6Q9ER75 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
Irx6Q9ER75 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Irx6Q9ER75 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,01■■■■□ 3,51
Irx6Q9ER75 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Irx6Q9ER75 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Irx6Q9ER75 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Irx6Q9ER75 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,89■■■■□ 3,5
Irx6Q9ER75 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Irx6Q9ER75 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Irx6Q9ER75 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Irx6Q9ER75 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Irx6Q9ER75 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,78■■■■□ 3,48
Irx6Q9ER75 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Irx6Q9ER75 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Irx6Q9ER75 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,77■■■■□ 3,48
Irx6Q9ER75 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,76■■■■□ 3,48
Irx6Q9ER75 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Irx6Q9ER75 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36,64■■■■□ 3,46
Irx6Q9ER75 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Irx6Q9ER75 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Irx6Q9ER75 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Irx6Q9ER75 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Irx6Q9ER75 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,6■■■■□ 3,45
Irx6Q9ER75 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Irx6Q9ER75 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Irx6Q9ER75 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Irx6Q9ER75 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,54■■■■□ 3,44
Irx6Q9ER75 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Irx6Q9ER75 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Irx6Q9ER75 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Irx6Q9ER75 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Irx6Q9ER75 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Irx6Q9ER75 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
Irx6Q9ER75 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Irx6Q9ER75 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Irx6Q9ER75 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,34■■■■□ 3,41
Irx6Q9ER75 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
Irx6Q9ER75 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Irx6Q9ER75 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms