Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,22■■■■■ 5,31
Gja3Q64448 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,1■■■■■ 4,81
Gja3Q64448 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,37■■■■■ 4,69
Gja3Q64448 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,4■■■■■ 4,38
Gja3Q64448 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,09■■■■■ 4,17
Gja3Q64448 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Gja3Q64448 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Gja3Q64448 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Gja3Q64448 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Gja3Q64448 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,15■■■■■ 4,02
Gja3Q64448 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,93■■■■□ 3,98
Gja3Q64448 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,88■■■■□ 3,97
Gja3Q64448 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Gja3Q64448 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,6■■■■□ 3,93
Gja3Q64448 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Gja3Q64448 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Gja3Q64448 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Gja3Q64448 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,56■■■■□ 3,76
Gja3Q64448 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
Gja3Q64448 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,38■■■■□ 3,73
Gja3Q64448 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Gja3Q64448 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Gja3Q64448 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,61
Gja3Q64448 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,57■■■■□ 3,6
Gja3Q64448 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,44■■■■□ 3,58
Gja3Q64448 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,38■■■■□ 3,57
Gja3Q64448 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Gja3Q64448 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Gja3Q64448 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36,9■■■■□ 3,5
Gja3Q64448 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,87■■■■□ 3,49
Gja3Q64448 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,86■■■■□ 3,49
Gja3Q64448 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Gja3Q64448 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,57■■■■□ 3,44
Gja3Q64448 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Gja3Q64448 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,53■■■■□ 3,44
Gja3Q64448 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Gja3Q64448 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Gja3Q64448 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Gja3Q64448 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Gja3Q64448 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Gja3Q64448 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Gja3Q64448 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Gja3Q64448 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Gja3Q64448 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Gja3Q64448 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,87■■■■□ 3,33
Gja3Q64448 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Gja3Q64448 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Gja3Q64448 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
Gja3Q64448 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Gja3Q64448 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Gja3Q64448 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Gja3Q64448 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,46■■■■□ 3,27
Gja3Q64448 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Gja3Q64448 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Gja3Q64448 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Gja3Q64448 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Gja3Q64448 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,26■■■■□ 3,24
Gja3Q64448 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Gja3Q64448 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,17■■■■□ 3,22
Gja3Q64448 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Gja3Q64448 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Gja3Q64448 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Gja3Q64448 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Gja3Q64448 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,05■■■■□ 3,2
Gja3Q64448 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Gja3Q64448 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
Gja3Q64448 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Gja3Q64448 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Gja3Q64448 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Gja3Q64448 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Gja3Q64448 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Gja3Q64448 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Gja3Q64448 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,67■■■■□ 3,14
Gja3Q64448 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Gja3Q64448 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Gja3Q64448 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Gja3Q64448 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Gja3Q64448 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Gja3Q64448 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,53■■■■□ 3,12
Gja3Q64448 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Gja3Q64448 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Gja3Q64448 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Gja3Q64448 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Gja3Q64448 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,1
Gja3Q64448 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Gja3Q64448 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Gja3Q64448 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Gja3Q64448 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Gja3Q64448 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Gja3Q64448 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Gja3Q64448 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Gja3Q64448 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Gja3Q64448 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Gja3Q64448 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Gja3Q64448 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Gja3Q64448 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Gja3Q64448 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
Gja3Q64448 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Gja3Q64448 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Gja3Q64448 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,3 ms