Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.53■■■■■ 5.52
Wdhd1P59328 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Wdhd1P59328 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Wdhd1P59328 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
Wdhd1P59328 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
Wdhd1P59328 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Wdhd1P59328 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Wdhd1P59328 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Wdhd1P59328 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
Wdhd1P59328 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
Wdhd1P59328 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Wdhd1P59328 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Wdhd1P59328 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Wdhd1P59328 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Wdhd1P59328 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Wdhd1P59328 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Wdhd1P59328 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Wdhd1P59328 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Wdhd1P59328 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Wdhd1P59328 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Wdhd1P59328 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Wdhd1P59328 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Wdhd1P59328 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Wdhd1P59328 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Wdhd1P59328 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Wdhd1P59328 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Wdhd1P59328 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Wdhd1P59328 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Wdhd1P59328 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Wdhd1P59328 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Wdhd1P59328 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Wdhd1P59328 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Wdhd1P59328 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Wdhd1P59328 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Wdhd1P59328 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Wdhd1P59328 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Wdhd1P59328 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Wdhd1P59328 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Wdhd1P59328 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Wdhd1P59328 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Wdhd1P59328 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Wdhd1P59328 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Wdhd1P59328 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Wdhd1P59328 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Wdhd1P59328 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Wdhd1P59328 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Wdhd1P59328 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Wdhd1P59328 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Wdhd1P59328 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Wdhd1P59328 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Wdhd1P59328 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Wdhd1P59328 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Wdhd1P59328 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Wdhd1P59328 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Wdhd1P59328 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Wdhd1P59328 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Wdhd1P59328 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Wdhd1P59328 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Wdhd1P59328 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Wdhd1P59328 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Wdhd1P59328 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Wdhd1P59328 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Wdhd1P59328 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Wdhd1P59328 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Wdhd1P59328 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Wdhd1P59328 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Wdhd1P59328 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Wdhd1P59328 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Wdhd1P59328 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Wdhd1P59328 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Wdhd1P59328 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Wdhd1P59328 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Wdhd1P59328 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Wdhd1P59328 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Wdhd1P59328 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Wdhd1P59328 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Wdhd1P59328 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Wdhd1P59328 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Wdhd1P59328 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Wdhd1P59328 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Wdhd1P59328 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Wdhd1P59328 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Wdhd1P59328 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Wdhd1P59328 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Wdhd1P59328 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Wdhd1P59328 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Wdhd1P59328 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Wdhd1P59328 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Wdhd1P59328 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Wdhd1P59328 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Wdhd1P59328 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Wdhd1P59328 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Wdhd1P59328 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Wdhd1P59328 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Wdhd1P59328 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Wdhd1P59328 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Wdhd1P59328 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Wdhd1P59328 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Wdhd1P59328 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Wdhd1P59328 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms