Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.17■■■■■ 5.46
Gja5Q01231 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Gja5Q01231 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Gja5Q01231 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Gja5Q01231 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Gja5Q01231 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Gja5Q01231 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
Gja5Q01231 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Gja5Q01231 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Gja5Q01231 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Gja5Q01231 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
Gja5Q01231 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Gja5Q01231 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Gja5Q01231 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Gja5Q01231 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Gja5Q01231 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Gja5Q01231 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Gja5Q01231 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Gja5Q01231 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Gja5Q01231 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Gja5Q01231 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Gja5Q01231 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Gja5Q01231 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Gja5Q01231 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Gja5Q01231 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Gja5Q01231 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Gja5Q01231 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Gja5Q01231 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Gja5Q01231 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Gja5Q01231 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Gja5Q01231 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Gja5Q01231 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Gja5Q01231 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Gja5Q01231 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Gja5Q01231 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Gja5Q01231 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Gja5Q01231 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Gja5Q01231 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Gja5Q01231 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Gja5Q01231 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Gja5Q01231 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Gja5Q01231 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Gja5Q01231 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Gja5Q01231 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Gja5Q01231 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Gja5Q01231 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Gja5Q01231 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Gja5Q01231 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Gja5Q01231 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Gja5Q01231 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Gja5Q01231 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Gja5Q01231 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Gja5Q01231 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Gja5Q01231 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gja5Q01231 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Gja5Q01231 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Gja5Q01231 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Gja5Q01231 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Gja5Q01231 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Gja5Q01231 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gja5Q01231 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gja5Q01231 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Gja5Q01231 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Gja5Q01231 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
Gja5Q01231 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Gja5Q01231 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Gja5Q01231 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Gja5Q01231 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Gja5Q01231 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Gja5Q01231 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Gja5Q01231 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Gja5Q01231 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Gja5Q01231 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gja5Q01231 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gja5Q01231 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Gja5Q01231 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Gja5Q01231 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gja5Q01231 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Gja5Q01231 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Gja5Q01231 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Gja5Q01231 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Gja5Q01231 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gja5Q01231 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Gja5Q01231 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Gja5Q01231 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Gja5Q01231 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Gja5Q01231 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Gja5Q01231 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Gja5Q01231 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Gja5Q01231 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Gja5Q01231 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gja5Q01231 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Gja5Q01231 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Gja5Q01231 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Gja5Q01231 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Gja5Q01231 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Gja5Q01231 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Gja5Q01231 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Gja5Q01231 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Gja5Q01231 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms