Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.94■■■■■ 5.59
Lrrc43Q3V0L5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Lrrc43Q3V0L5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Lrrc43Q3V0L5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
Lrrc43Q3V0L5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Lrrc43Q3V0L5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Lrrc43Q3V0L5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
Lrrc43Q3V0L5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Lrrc43Q3V0L5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Lrrc43Q3V0L5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Lrrc43Q3V0L5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Lrrc43Q3V0L5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Lrrc43Q3V0L5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Lrrc43Q3V0L5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Lrrc43Q3V0L5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Lrrc43Q3V0L5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Lrrc43Q3V0L5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Lrrc43Q3V0L5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Lrrc43Q3V0L5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Lrrc43Q3V0L5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Lrrc43Q3V0L5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Lrrc43Q3V0L5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Lrrc43Q3V0L5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Lrrc43Q3V0L5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Lrrc43Q3V0L5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Lrrc43Q3V0L5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Lrrc43Q3V0L5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Lrrc43Q3V0L5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Lrrc43Q3V0L5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Lrrc43Q3V0L5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lrrc43Q3V0L5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lrrc43Q3V0L5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Lrrc43Q3V0L5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Lrrc43Q3V0L5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Lrrc43Q3V0L5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Lrrc43Q3V0L5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Lrrc43Q3V0L5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Lrrc43Q3V0L5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Lrrc43Q3V0L5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lrrc43Q3V0L5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Lrrc43Q3V0L5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Lrrc43Q3V0L5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Lrrc43Q3V0L5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Lrrc43Q3V0L5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lrrc43Q3V0L5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Lrrc43Q3V0L5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lrrc43Q3V0L5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Lrrc43Q3V0L5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Lrrc43Q3V0L5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Lrrc43Q3V0L5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Lrrc43Q3V0L5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Lrrc43Q3V0L5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Lrrc43Q3V0L5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Lrrc43Q3V0L5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Lrrc43Q3V0L5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Lrrc43Q3V0L5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lrrc43Q3V0L5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lrrc43Q3V0L5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lrrc43Q3V0L5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lrrc43Q3V0L5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lrrc43Q3V0L5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lrrc43Q3V0L5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lrrc43Q3V0L5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Lrrc43Q3V0L5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lrrc43Q3V0L5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrrc43Q3V0L5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrrc43Q3V0L5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrrc43Q3V0L5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrrc43Q3V0L5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrrc43Q3V0L5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lrrc43Q3V0L5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lrrc43Q3V0L5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lrrc43Q3V0L5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lrrc43Q3V0L5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lrrc43Q3V0L5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Lrrc43Q3V0L5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Lrrc43Q3V0L5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lrrc43Q3V0L5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lrrc43Q3V0L5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lrrc43Q3V0L5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lrrc43Q3V0L5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms