Protein–RNA interactions for Protein: S4R325

URGCP-MRPS24, URGCP-MRPS24 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URGCP-MRPS24S4R325 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
URGCP-MRPS24S4R325 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
URGCP-MRPS24S4R325 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
URGCP-MRPS24S4R325 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
URGCP-MRPS24S4R325 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
URGCP-MRPS24S4R325 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
URGCP-MRPS24S4R325 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
URGCP-MRPS24S4R325 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
URGCP-MRPS24S4R325 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
URGCP-MRPS24S4R325 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
URGCP-MRPS24S4R325 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
URGCP-MRPS24S4R325 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
URGCP-MRPS24S4R325 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
URGCP-MRPS24S4R325 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
URGCP-MRPS24S4R325 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
URGCP-MRPS24S4R325 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
URGCP-MRPS24S4R325 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
URGCP-MRPS24S4R325 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
URGCP-MRPS24S4R325 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
URGCP-MRPS24S4R325 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
URGCP-MRPS24S4R325 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
URGCP-MRPS24S4R325 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
URGCP-MRPS24S4R325 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
URGCP-MRPS24S4R325 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
URGCP-MRPS24S4R325 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
URGCP-MRPS24S4R325 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
URGCP-MRPS24S4R325 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
URGCP-MRPS24S4R325 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
URGCP-MRPS24S4R325 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
URGCP-MRPS24S4R325 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
URGCP-MRPS24S4R325 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
URGCP-MRPS24S4R325 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
URGCP-MRPS24S4R325 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
URGCP-MRPS24S4R325 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
URGCP-MRPS24S4R325 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
URGCP-MRPS24S4R325 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
URGCP-MRPS24S4R325 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
URGCP-MRPS24S4R325 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
URGCP-MRPS24S4R325 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
URGCP-MRPS24S4R325 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
URGCP-MRPS24S4R325 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
URGCP-MRPS24S4R325 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
URGCP-MRPS24S4R325 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
URGCP-MRPS24S4R325 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
URGCP-MRPS24S4R325 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
URGCP-MRPS24S4R325 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
URGCP-MRPS24S4R325 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
URGCP-MRPS24S4R325 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
URGCP-MRPS24S4R325 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
URGCP-MRPS24S4R325 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
URGCP-MRPS24S4R325 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
URGCP-MRPS24S4R325 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
URGCP-MRPS24S4R325 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
URGCP-MRPS24S4R325 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
URGCP-MRPS24S4R325 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
URGCP-MRPS24S4R325 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
URGCP-MRPS24S4R325 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
URGCP-MRPS24S4R325 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
URGCP-MRPS24S4R325 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
URGCP-MRPS24S4R325 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
URGCP-MRPS24S4R325 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
URGCP-MRPS24S4R325 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
URGCP-MRPS24S4R325 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
URGCP-MRPS24S4R325 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
URGCP-MRPS24S4R325 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
URGCP-MRPS24S4R325 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
URGCP-MRPS24S4R325 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
URGCP-MRPS24S4R325 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
URGCP-MRPS24S4R325 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
URGCP-MRPS24S4R325 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
URGCP-MRPS24S4R325 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
URGCP-MRPS24S4R325 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
URGCP-MRPS24S4R325 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
URGCP-MRPS24S4R325 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
URGCP-MRPS24S4R325 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
URGCP-MRPS24S4R325 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
URGCP-MRPS24S4R325 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
URGCP-MRPS24S4R325 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
URGCP-MRPS24S4R325 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
URGCP-MRPS24S4R325 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
URGCP-MRPS24S4R325 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
URGCP-MRPS24S4R325 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
URGCP-MRPS24S4R325 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
URGCP-MRPS24S4R325 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
URGCP-MRPS24S4R325 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
URGCP-MRPS24S4R325 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
URGCP-MRPS24S4R325 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
URGCP-MRPS24S4R325 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
URGCP-MRPS24S4R325 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
URGCP-MRPS24S4R325 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
URGCP-MRPS24S4R325 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
URGCP-MRPS24S4R325 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
URGCP-MRPS24S4R325 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
URGCP-MRPS24S4R325 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
URGCP-MRPS24S4R325 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
URGCP-MRPS24S4R325 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
URGCP-MRPS24S4R325 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
URGCP-MRPS24S4R325 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
URGCP-MRPS24S4R325 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
URGCP-MRPS24S4R325 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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