Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSENENQ9NZ42 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSENENQ9NZ42 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSENENQ9NZ42 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSENENQ9NZ42 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSENENQ9NZ42 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSENENQ9NZ42 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSENENQ9NZ42 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PSENENQ9NZ42 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSENENQ9NZ42 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSENENQ9NZ42 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSENENQ9NZ42 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSENENQ9NZ42 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSENENQ9NZ42 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSENENQ9NZ42 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSENENQ9NZ42 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSENENQ9NZ42 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSENENQ9NZ42 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSENENQ9NZ42 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSENENQ9NZ42 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSENENQ9NZ42 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSENENQ9NZ42 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSENENQ9NZ42 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSENENQ9NZ42 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSENENQ9NZ42 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSENENQ9NZ42 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSENENQ9NZ42 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSENENQ9NZ42 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSENENQ9NZ42 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSENENQ9NZ42 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSENENQ9NZ42 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSENENQ9NZ42 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSENENQ9NZ42 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSENENQ9NZ42 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSENENQ9NZ42 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSENENQ9NZ42 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSENENQ9NZ42 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSENENQ9NZ42 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSENENQ9NZ42 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSENENQ9NZ42 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSENENQ9NZ42 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSENENQ9NZ42 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSENENQ9NZ42 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSENENQ9NZ42 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSENENQ9NZ42 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSENENQ9NZ42 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSENENQ9NZ42 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSENENQ9NZ42 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSENENQ9NZ42 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSENENQ9NZ42 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSENENQ9NZ42 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSENENQ9NZ42 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSENENQ9NZ42 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSENENQ9NZ42 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSENENQ9NZ42 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSENENQ9NZ42 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSENENQ9NZ42 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSENENQ9NZ42 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSENENQ9NZ42 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSENENQ9NZ42 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSENENQ9NZ42 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSENENQ9NZ42 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSENENQ9NZ42 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSENENQ9NZ42 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSENENQ9NZ42 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSENENQ9NZ42 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSENENQ9NZ42 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSENENQ9NZ42 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSENENQ9NZ42 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSENENQ9NZ42 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSENENQ9NZ42 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSENENQ9NZ42 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSENENQ9NZ42 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSENENQ9NZ42 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSENENQ9NZ42 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSENENQ9NZ42 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSENENQ9NZ42 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSENENQ9NZ42 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSENENQ9NZ42 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSENENQ9NZ42 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSENENQ9NZ42 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSENENQ9NZ42 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSENENQ9NZ42 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSENENQ9NZ42 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSENENQ9NZ42 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSENENQ9NZ42 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSENENQ9NZ42 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSENENQ9NZ42 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSENENQ9NZ42 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSENENQ9NZ42 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSENENQ9NZ42 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSENENQ9NZ42 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSENENQ9NZ42 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSENENQ9NZ42 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSENENQ9NZ42 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSENENQ9NZ42 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSENENQ9NZ42 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSENENQ9NZ42 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSENENQ9NZ42 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSENENQ9NZ42 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms