Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q80

DERL3, Derlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERL3Q96Q80 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DERL3Q96Q80 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DERL3Q96Q80 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DERL3Q96Q80 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DERL3Q96Q80 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DERL3Q96Q80 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DERL3Q96Q80 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DERL3Q96Q80 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DERL3Q96Q80 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DERL3Q96Q80 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DERL3Q96Q80 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DERL3Q96Q80 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DERL3Q96Q80 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DERL3Q96Q80 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DERL3Q96Q80 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DERL3Q96Q80 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DERL3Q96Q80 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DERL3Q96Q80 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DERL3Q96Q80 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DERL3Q96Q80 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DERL3Q96Q80 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DERL3Q96Q80 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DERL3Q96Q80 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DERL3Q96Q80 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DERL3Q96Q80 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DERL3Q96Q80 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DERL3Q96Q80 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DERL3Q96Q80 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DERL3Q96Q80 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DERL3Q96Q80 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DERL3Q96Q80 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DERL3Q96Q80 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DERL3Q96Q80 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DERL3Q96Q80 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DERL3Q96Q80 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DERL3Q96Q80 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DERL3Q96Q80 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DERL3Q96Q80 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DERL3Q96Q80 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DERL3Q96Q80 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DERL3Q96Q80 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DERL3Q96Q80 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DERL3Q96Q80 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DERL3Q96Q80 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DERL3Q96Q80 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DERL3Q96Q80 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DERL3Q96Q80 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DERL3Q96Q80 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DERL3Q96Q80 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DERL3Q96Q80 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DERL3Q96Q80 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DERL3Q96Q80 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DERL3Q96Q80 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DERL3Q96Q80 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DERL3Q96Q80 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DERL3Q96Q80 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DERL3Q96Q80 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DERL3Q96Q80 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DERL3Q96Q80 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DERL3Q96Q80 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DERL3Q96Q80 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DERL3Q96Q80 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DERL3Q96Q80 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DERL3Q96Q80 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DERL3Q96Q80 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DERL3Q96Q80 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DERL3Q96Q80 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DERL3Q96Q80 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DERL3Q96Q80 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DERL3Q96Q80 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DERL3Q96Q80 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DERL3Q96Q80 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DERL3Q96Q80 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DERL3Q96Q80 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DERL3Q96Q80 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DERL3Q96Q80 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DERL3Q96Q80 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DERL3Q96Q80 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DERL3Q96Q80 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DERL3Q96Q80 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DERL3Q96Q80 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DERL3Q96Q80 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DERL3Q96Q80 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DERL3Q96Q80 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DERL3Q96Q80 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DERL3Q96Q80 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DERL3Q96Q80 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DERL3Q96Q80 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DERL3Q96Q80 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DERL3Q96Q80 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DERL3Q96Q80 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms