Protein–RNA interactions for Protein: Q96A08

HIST1H2BA, Histone H2B type 1-A, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2BAQ96A08 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
HIST1H2BAQ96A08 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIST1H2BAQ96A08 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIST1H2BAQ96A08 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIST1H2BAQ96A08 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIST1H2BAQ96A08 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIST1H2BAQ96A08 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIST1H2BAQ96A08 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIST1H2BAQ96A08 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIST1H2BAQ96A08 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIST1H2BAQ96A08 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIST1H2BAQ96A08 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIST1H2BAQ96A08 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIST1H2BAQ96A08 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIST1H2BAQ96A08 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIST1H2BAQ96A08 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIST1H2BAQ96A08 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIST1H2BAQ96A08 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIST1H2BAQ96A08 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HIST1H2BAQ96A08 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIST1H2BAQ96A08 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIST1H2BAQ96A08 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIST1H2BAQ96A08 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIST1H2BAQ96A08 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIST1H2BAQ96A08 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIST1H2BAQ96A08 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST1H2BAQ96A08 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST1H2BAQ96A08 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST1H2BAQ96A08 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST1H2BAQ96A08 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIST1H2BAQ96A08 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIST1H2BAQ96A08 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST1H2BAQ96A08 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIST1H2BAQ96A08 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIST1H2BAQ96A08 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIST1H2BAQ96A08 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIST1H2BAQ96A08 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIST1H2BAQ96A08 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIST1H2BAQ96A08 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIST1H2BAQ96A08 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIST1H2BAQ96A08 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIST1H2BAQ96A08 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIST1H2BAQ96A08 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIST1H2BAQ96A08 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST1H2BAQ96A08 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIST1H2BAQ96A08 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST1H2BAQ96A08 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST1H2BAQ96A08 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST1H2BAQ96A08 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST1H2BAQ96A08 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST1H2BAQ96A08 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST1H2BAQ96A08 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST1H2BAQ96A08 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST1H2BAQ96A08 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST1H2BAQ96A08 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST1H2BAQ96A08 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST1H2BAQ96A08 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST1H2BAQ96A08 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST1H2BAQ96A08 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST1H2BAQ96A08 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST1H2BAQ96A08 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIST1H2BAQ96A08 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST1H2BAQ96A08 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST1H2BAQ96A08 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST1H2BAQ96A08 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST1H2BAQ96A08 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST1H2BAQ96A08 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIST1H2BAQ96A08 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST1H2BAQ96A08 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST1H2BAQ96A08 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H2BAQ96A08 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2BAQ96A08 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H2BAQ96A08 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2BAQ96A08 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2BAQ96A08 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIST1H2BAQ96A08 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST1H2BAQ96A08 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST1H2BAQ96A08 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST1H2BAQ96A08 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST1H2BAQ96A08 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST1H2BAQ96A08 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST1H2BAQ96A08 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST1H2BAQ96A08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST1H2BAQ96A08 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST1H2BAQ96A08 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIST1H2BAQ96A08 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST1H2BAQ96A08 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIST1H2BAQ96A08 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIST1H2BAQ96A08 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H2BAQ96A08 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST1H2BAQ96A08 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST1H2BAQ96A08 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST1H2BAQ96A08 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST1H2BAQ96A08 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST1H2BAQ96A08 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST1H2BAQ96A08 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST1H2BAQ96A08 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2BAQ96A08 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2BAQ96A08 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST1H2BAQ96A08 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms