Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ2

HPSE2, Inactive heparanase-2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSE2Q8WWQ2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPSE2Q8WWQ2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPSE2Q8WWQ2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HPSE2Q8WWQ2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPSE2Q8WWQ2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HPSE2Q8WWQ2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPSE2Q8WWQ2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HPSE2Q8WWQ2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPSE2Q8WWQ2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPSE2Q8WWQ2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HPSE2Q8WWQ2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPSE2Q8WWQ2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPSE2Q8WWQ2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HPSE2Q8WWQ2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPSE2Q8WWQ2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPSE2Q8WWQ2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPSE2Q8WWQ2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPSE2Q8WWQ2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPSE2Q8WWQ2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HPSE2Q8WWQ2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPSE2Q8WWQ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPSE2Q8WWQ2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPSE2Q8WWQ2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPSE2Q8WWQ2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPSE2Q8WWQ2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPSE2Q8WWQ2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPSE2Q8WWQ2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPSE2Q8WWQ2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPSE2Q8WWQ2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPSE2Q8WWQ2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSE2Q8WWQ2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSE2Q8WWQ2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPSE2Q8WWQ2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPSE2Q8WWQ2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPSE2Q8WWQ2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPSE2Q8WWQ2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPSE2Q8WWQ2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPSE2Q8WWQ2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPSE2Q8WWQ2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPSE2Q8WWQ2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPSE2Q8WWQ2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPSE2Q8WWQ2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPSE2Q8WWQ2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPSE2Q8WWQ2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPSE2Q8WWQ2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPSE2Q8WWQ2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSE2Q8WWQ2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSE2Q8WWQ2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSE2Q8WWQ2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSE2Q8WWQ2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSE2Q8WWQ2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPSE2Q8WWQ2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSE2Q8WWQ2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPSE2Q8WWQ2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPSE2Q8WWQ2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPSE2Q8WWQ2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPSE2Q8WWQ2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPSE2Q8WWQ2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPSE2Q8WWQ2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPSE2Q8WWQ2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPSE2Q8WWQ2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPSE2Q8WWQ2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPSE2Q8WWQ2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSE2Q8WWQ2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPSE2Q8WWQ2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPSE2Q8WWQ2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPSE2Q8WWQ2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPSE2Q8WWQ2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPSE2Q8WWQ2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPSE2Q8WWQ2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSE2Q8WWQ2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSE2Q8WWQ2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPSE2Q8WWQ2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSE2Q8WWQ2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSE2Q8WWQ2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSE2Q8WWQ2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSE2Q8WWQ2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPSE2Q8WWQ2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPSE2Q8WWQ2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPSE2Q8WWQ2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPSE2Q8WWQ2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPSE2Q8WWQ2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPSE2Q8WWQ2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPSE2Q8WWQ2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPSE2Q8WWQ2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPSE2Q8WWQ2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPSE2Q8WWQ2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPSE2Q8WWQ2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPSE2Q8WWQ2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HPSE2Q8WWQ2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPSE2Q8WWQ2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPSE2Q8WWQ2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPSE2Q8WWQ2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPSE2Q8WWQ2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPSE2Q8WWQ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPSE2Q8WWQ2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPSE2Q8WWQ2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPSE2Q8WWQ2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPSE2Q8WWQ2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPSE2Q8WWQ2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms