Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SPATA4Q8NEY3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SPATA4Q8NEY3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SPATA4Q8NEY3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SPATA4Q8NEY3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SPATA4Q8NEY3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SPATA4Q8NEY3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SPATA4Q8NEY3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPATA4Q8NEY3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPATA4Q8NEY3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPATA4Q8NEY3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SPATA4Q8NEY3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPATA4Q8NEY3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPATA4Q8NEY3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SPATA4Q8NEY3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SPATA4Q8NEY3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SPATA4Q8NEY3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SPATA4Q8NEY3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SPATA4Q8NEY3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SPATA4Q8NEY3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SPATA4Q8NEY3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SPATA4Q8NEY3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPATA4Q8NEY3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPATA4Q8NEY3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPATA4Q8NEY3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPATA4Q8NEY3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPATA4Q8NEY3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SPATA4Q8NEY3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPATA4Q8NEY3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPATA4Q8NEY3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPATA4Q8NEY3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPATA4Q8NEY3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPATA4Q8NEY3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPATA4Q8NEY3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPATA4Q8NEY3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SPATA4Q8NEY3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SPATA4Q8NEY3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SPATA4Q8NEY3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SPATA4Q8NEY3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SPATA4Q8NEY3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SPATA4Q8NEY3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPATA4Q8NEY3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPATA4Q8NEY3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPATA4Q8NEY3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SPATA4Q8NEY3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SPATA4Q8NEY3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPATA4Q8NEY3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPATA4Q8NEY3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SPATA4Q8NEY3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SPATA4Q8NEY3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SPATA4Q8NEY3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SPATA4Q8NEY3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SPATA4Q8NEY3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SPATA4Q8NEY3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SPATA4Q8NEY3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SPATA4Q8NEY3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SPATA4Q8NEY3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SPATA4Q8NEY3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SPATA4Q8NEY3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SPATA4Q8NEY3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SPATA4Q8NEY3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SPATA4Q8NEY3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SPATA4Q8NEY3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SPATA4Q8NEY3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SPATA4Q8NEY3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SPATA4Q8NEY3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SPATA4Q8NEY3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SPATA4Q8NEY3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SPATA4Q8NEY3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SPATA4Q8NEY3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SPATA4Q8NEY3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SPATA4Q8NEY3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SPATA4Q8NEY3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SPATA4Q8NEY3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPATA4Q8NEY3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SPATA4Q8NEY3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SPATA4Q8NEY3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SPATA4Q8NEY3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SPATA4Q8NEY3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SPATA4Q8NEY3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SPATA4Q8NEY3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SPATA4Q8NEY3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SPATA4Q8NEY3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SPATA4Q8NEY3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SPATA4Q8NEY3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPATA4Q8NEY3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPATA4Q8NEY3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SPATA4Q8NEY3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SPATA4Q8NEY3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SPATA4Q8NEY3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SPATA4Q8NEY3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SPATA4Q8NEY3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SPATA4Q8NEY3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPATA4Q8NEY3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPATA4Q8NEY3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPATA4Q8NEY3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPATA4Q8NEY3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPATA4Q8NEY3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPATA4Q8NEY3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPATA4Q8NEY3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms