Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y29

BAGE3, B melanoma antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAGE3Q86Y29 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BAGE3Q86Y29 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BAGE3Q86Y29 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BAGE3Q86Y29 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BAGE3Q86Y29 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BAGE3Q86Y29 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BAGE3Q86Y29 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BAGE3Q86Y29 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAGE3Q86Y29 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BAGE3Q86Y29 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BAGE3Q86Y29 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BAGE3Q86Y29 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BAGE3Q86Y29 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BAGE3Q86Y29 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BAGE3Q86Y29 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BAGE3Q86Y29 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BAGE3Q86Y29 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BAGE3Q86Y29 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BAGE3Q86Y29 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BAGE3Q86Y29 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAGE3Q86Y29 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BAGE3Q86Y29 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BAGE3Q86Y29 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BAGE3Q86Y29 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BAGE3Q86Y29 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BAGE3Q86Y29 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BAGE3Q86Y29 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BAGE3Q86Y29 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BAGE3Q86Y29 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BAGE3Q86Y29 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BAGE3Q86Y29 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BAGE3Q86Y29 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BAGE3Q86Y29 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BAGE3Q86Y29 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BAGE3Q86Y29 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BAGE3Q86Y29 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BAGE3Q86Y29 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BAGE3Q86Y29 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BAGE3Q86Y29 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BAGE3Q86Y29 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAGE3Q86Y29 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAGE3Q86Y29 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAGE3Q86Y29 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAGE3Q86Y29 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAGE3Q86Y29 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAGE3Q86Y29 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAGE3Q86Y29 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAGE3Q86Y29 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAGE3Q86Y29 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAGE3Q86Y29 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAGE3Q86Y29 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAGE3Q86Y29 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAGE3Q86Y29 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BAGE3Q86Y29 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BAGE3Q86Y29 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BAGE3Q86Y29 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BAGE3Q86Y29 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BAGE3Q86Y29 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BAGE3Q86Y29 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BAGE3Q86Y29 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BAGE3Q86Y29 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BAGE3Q86Y29 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BAGE3Q86Y29 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BAGE3Q86Y29 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BAGE3Q86Y29 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BAGE3Q86Y29 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BAGE3Q86Y29 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BAGE3Q86Y29 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BAGE3Q86Y29 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BAGE3Q86Y29 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BAGE3Q86Y29 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BAGE3Q86Y29 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BAGE3Q86Y29 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BAGE3Q86Y29 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BAGE3Q86Y29 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BAGE3Q86Y29 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BAGE3Q86Y29 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BAGE3Q86Y29 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BAGE3Q86Y29 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BAGE3Q86Y29 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BAGE3Q86Y29 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BAGE3Q86Y29 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BAGE3Q86Y29 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BAGE3Q86Y29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BAGE3Q86Y29 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BAGE3Q86Y29 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BAGE3Q86Y29 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BAGE3Q86Y29 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAGE3Q86Y29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAGE3Q86Y29 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAGE3Q86Y29 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAGE3Q86Y29 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAGE3Q86Y29 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAGE3Q86Y29 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAGE3Q86Y29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAGE3Q86Y29 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BAGE3Q86Y29 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BAGE3Q86Y29 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BAGE3Q86Y29 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BAGE3Q86Y29 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms