Protein–RNA interactions for Protein: Q86VU5

COMTD1, Catechol O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTD1Q86VU5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COMTD1Q86VU5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
COMTD1Q86VU5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
COMTD1Q86VU5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COMTD1Q86VU5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COMTD1Q86VU5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COMTD1Q86VU5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COMTD1Q86VU5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COMTD1Q86VU5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COMTD1Q86VU5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COMTD1Q86VU5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COMTD1Q86VU5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COMTD1Q86VU5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COMTD1Q86VU5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COMTD1Q86VU5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COMTD1Q86VU5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COMTD1Q86VU5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COMTD1Q86VU5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COMTD1Q86VU5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COMTD1Q86VU5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COMTD1Q86VU5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COMTD1Q86VU5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COMTD1Q86VU5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COMTD1Q86VU5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COMTD1Q86VU5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COMTD1Q86VU5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COMTD1Q86VU5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COMTD1Q86VU5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COMTD1Q86VU5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMTD1Q86VU5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COMTD1Q86VU5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COMTD1Q86VU5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COMTD1Q86VU5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COMTD1Q86VU5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COMTD1Q86VU5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COMTD1Q86VU5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COMTD1Q86VU5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COMTD1Q86VU5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COMTD1Q86VU5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COMTD1Q86VU5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COMTD1Q86VU5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COMTD1Q86VU5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COMTD1Q86VU5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COMTD1Q86VU5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COMTD1Q86VU5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COMTD1Q86VU5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COMTD1Q86VU5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COMTD1Q86VU5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COMTD1Q86VU5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COMTD1Q86VU5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COMTD1Q86VU5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
COMTD1Q86VU5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COMTD1Q86VU5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COMTD1Q86VU5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COMTD1Q86VU5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COMTD1Q86VU5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COMTD1Q86VU5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COMTD1Q86VU5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COMTD1Q86VU5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COMTD1Q86VU5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COMTD1Q86VU5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COMTD1Q86VU5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COMTD1Q86VU5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COMTD1Q86VU5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COMTD1Q86VU5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COMTD1Q86VU5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COMTD1Q86VU5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COMTD1Q86VU5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COMTD1Q86VU5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COMTD1Q86VU5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COMTD1Q86VU5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COMTD1Q86VU5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COMTD1Q86VU5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COMTD1Q86VU5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COMTD1Q86VU5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COMTD1Q86VU5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COMTD1Q86VU5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COMTD1Q86VU5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COMTD1Q86VU5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COMTD1Q86VU5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COMTD1Q86VU5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COMTD1Q86VU5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COMTD1Q86VU5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COMTD1Q86VU5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COMTD1Q86VU5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COMTD1Q86VU5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COMTD1Q86VU5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COMTD1Q86VU5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
COMTD1Q86VU5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COMTD1Q86VU5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COMTD1Q86VU5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COMTD1Q86VU5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COMTD1Q86VU5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COMTD1Q86VU5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COMTD1Q86VU5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COMTD1Q86VU5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COMTD1Q86VU5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COMTD1Q86VU5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COMTD1Q86VU5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COMTD1Q86VU5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms