Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2D3P61077 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2D3P61077 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2D3P61077 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2D3P61077 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2D3P61077 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2D3P61077 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2D3P61077 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2D3P61077 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2D3P61077 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2D3P61077 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2D3P61077 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2D3P61077 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2D3P61077 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2D3P61077 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2D3P61077 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2D3P61077 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2D3P61077 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2D3P61077 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2D3P61077 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2D3P61077 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2D3P61077 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2D3P61077 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2D3P61077 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2D3P61077 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2D3P61077 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2D3P61077 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2D3P61077 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2D3P61077 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2D3P61077 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2D3P61077 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2D3P61077 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2D3P61077 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2D3P61077 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2D3P61077 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2D3P61077 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2D3P61077 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2D3P61077 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2D3P61077 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2D3P61077 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2D3P61077 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2D3P61077 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2D3P61077 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2D3P61077 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2D3P61077 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2D3P61077 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2D3P61077 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2D3P61077 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2D3P61077 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2D3P61077 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2D3P61077 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2D3P61077 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2D3P61077 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2D3P61077 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2D3P61077 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2D3P61077 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2D3P61077 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2D3P61077 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2D3P61077 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2D3P61077 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2D3P61077 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2D3P61077 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2D3P61077 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2D3P61077 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2D3P61077 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2D3P61077 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2D3P61077 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2D3P61077 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2D3P61077 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2D3P61077 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2D3P61077 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2D3P61077 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE2D3P61077 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE2D3P61077 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE2D3P61077 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE2D3P61077 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2D3P61077 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2D3P61077 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2D3P61077 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE2D3P61077 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2D3P61077 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2D3P61077 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2D3P61077 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2D3P61077 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2D3P61077 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2D3P61077 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2D3P61077 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2D3P61077 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2D3P61077 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2D3P61077 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2D3P61077 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms