Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PPP5CP53041 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPP5CP53041 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPP5CP53041 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP5CP53041 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP5CP53041 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP5CP53041 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP5CP53041 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP5CP53041 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP5CP53041 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP5CP53041 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP5CP53041 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP5CP53041 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP5CP53041 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP5CP53041 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP5CP53041 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP5CP53041 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP5CP53041 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP5CP53041 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP5CP53041 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP5CP53041 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP5CP53041 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP5CP53041 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP5CP53041 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP5CP53041 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP5CP53041 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP5CP53041 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP5CP53041 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP5CP53041 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP5CP53041 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP5CP53041 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP5CP53041 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP5CP53041 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP5CP53041 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP5CP53041 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP5CP53041 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP5CP53041 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP5CP53041 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP5CP53041 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP5CP53041 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP5CP53041 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP5CP53041 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP5CP53041 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP5CP53041 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPP5CP53041 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP5CP53041 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP5CP53041 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP5CP53041 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP5CP53041 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP5CP53041 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP5CP53041 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP5CP53041 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP5CP53041 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP5CP53041 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP5CP53041 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPP5CP53041 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP5CP53041 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP5CP53041 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP5CP53041 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPP5CP53041 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP5CP53041 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP5CP53041 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP5CP53041 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP5CP53041 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP5CP53041 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP5CP53041 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP5CP53041 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP5CP53041 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP5CP53041 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPP5CP53041 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPP5CP53041 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP5CP53041 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPP5CP53041 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP5CP53041 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP5CP53041 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP5CP53041 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP5CP53041 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP5CP53041 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP5CP53041 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP5CP53041 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPP5CP53041 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP5CP53041 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP5CP53041 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP5CP53041 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP5CP53041 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP5CP53041 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP5CP53041 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP5CP53041 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP5CP53041 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP5CP53041 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP5CP53041 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP5CP53041 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP5CP53041 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP5CP53041 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP5CP53041 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP5CP53041 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP5CP53041 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP5CP53041 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP5CP53041 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP5CP53041 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms