Protein–RNA interactions for Protein: P26447

S100A4, Protein S100-A4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A4P26447 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
S100A4P26447 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
S100A4P26447 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
S100A4P26447 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
S100A4P26447 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
S100A4P26447 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
S100A4P26447 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
S100A4P26447 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24■■□□□ 1.43
S100A4P26447 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
S100A4P26447 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
S100A4P26447 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
S100A4P26447 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100A4P26447 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
S100A4P26447 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S100A4P26447 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S100A4P26447 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
S100A4P26447 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S100A4P26447 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
S100A4P26447 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S100A4P26447 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S100A4P26447 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
S100A4P26447 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S100A4P26447 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S100A4P26447 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S100A4P26447 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
S100A4P26447 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
S100A4P26447 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S100A4P26447 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
S100A4P26447 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
S100A4P26447 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
S100A4P26447 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S100A4P26447 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S100A4P26447 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
S100A4P26447 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S100A4P26447 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
S100A4P26447 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
S100A4P26447 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
S100A4P26447 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
S100A4P26447 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S100A4P26447 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S100A4P26447 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S100A4P26447 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S100A4P26447 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S100A4P26447 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S100A4P26447 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S100A4P26447 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S100A4P26447 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S100A4P26447 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S100A4P26447 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
S100A4P26447 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A4P26447 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A4P26447 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S100A4P26447 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S100A4P26447 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
S100A4P26447 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
S100A4P26447 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S100A4P26447 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
S100A4P26447 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
S100A4P26447 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
S100A4P26447 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
S100A4P26447 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
S100A4P26447 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
S100A4P26447 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
S100A4P26447 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
S100A4P26447 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
S100A4P26447 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
S100A4P26447 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
S100A4P26447 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
S100A4P26447 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
S100A4P26447 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
S100A4P26447 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
S100A4P26447 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
S100A4P26447 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
S100A4P26447 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
S100A4P26447 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
S100A4P26447 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
S100A4P26447 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
S100A4P26447 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
S100A4P26447 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
S100A4P26447 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
S100A4P26447 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
S100A4P26447 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
S100A4P26447 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
S100A4P26447 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
S100A4P26447 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
S100A4P26447 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
S100A4P26447 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
S100A4P26447 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
S100A4P26447 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
S100A4P26447 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
S100A4P26447 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S100A4P26447 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S100A4P26447 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
S100A4P26447 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
S100A4P26447 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S100A4P26447 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
S100A4P26447 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100A4P26447 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
S100A4P26447 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100A4P26447 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms