Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB3BP20337 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB3BP20337 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RAB3BP20337 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB3BP20337 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB3BP20337 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB3BP20337 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB3BP20337 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB3BP20337 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3BP20337 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB3BP20337 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAB3BP20337 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3BP20337 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3BP20337 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB3BP20337 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3BP20337 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3BP20337 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB3BP20337 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB3BP20337 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3BP20337 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3BP20337 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB3BP20337 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB3BP20337 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3BP20337 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3BP20337 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3BP20337 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3BP20337 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3BP20337 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3BP20337 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3BP20337 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3BP20337 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3BP20337 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3BP20337 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3BP20337 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3BP20337 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3BP20337 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3BP20337 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3BP20337 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3BP20337 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3BP20337 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3BP20337 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3BP20337 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3BP20337 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3BP20337 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3BP20337 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3BP20337 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3BP20337 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3BP20337 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3BP20337 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3BP20337 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3BP20337 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3BP20337 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3BP20337 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3BP20337 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3BP20337 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3BP20337 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3BP20337 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3BP20337 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3BP20337 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3BP20337 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3BP20337 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3BP20337 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3BP20337 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3BP20337 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3BP20337 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3BP20337 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3BP20337 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3BP20337 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3BP20337 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3BP20337 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3BP20337 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3BP20337 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3BP20337 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3BP20337 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3BP20337 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3BP20337 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3BP20337 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3BP20337 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3BP20337 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3BP20337 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3BP20337 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3BP20337 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3BP20337 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3BP20337 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB3BP20337 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3BP20337 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3BP20337 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3BP20337 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3BP20337 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3BP20337 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3BP20337 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3BP20337 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3BP20337 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB3BP20337 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3BP20337 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3BP20337 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3BP20337 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3BP20337 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB3BP20337 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3BP20337 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms