Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBBP0CG47 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBBP0CG47 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBBP0CG47 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBBP0CG47 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBBP0CG47 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBBP0CG47 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
UBBP0CG47 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBBP0CG47 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBBP0CG47 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBBP0CG47 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBBP0CG47 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBBP0CG47 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBBP0CG47 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBBP0CG47 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBBP0CG47 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBBP0CG47 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBBP0CG47 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBBP0CG47 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBBP0CG47 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBBP0CG47 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBBP0CG47 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBBP0CG47 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBBP0CG47 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBBP0CG47 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBBP0CG47 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBBP0CG47 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBBP0CG47 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBBP0CG47 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBBP0CG47 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBBP0CG47 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBBP0CG47 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBBP0CG47 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBBP0CG47 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBBP0CG47 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBBP0CG47 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBBP0CG47 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBBP0CG47 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBBP0CG47 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBBP0CG47 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBBP0CG47 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBBP0CG47 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBBP0CG47 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBBP0CG47 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBBP0CG47 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBBP0CG47 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBBP0CG47 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBBP0CG47 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBBP0CG47 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBBP0CG47 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBBP0CG47 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBBP0CG47 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBBP0CG47 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBBP0CG47 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBBP0CG47 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBBP0CG47 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBBP0CG47 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBBP0CG47 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBBP0CG47 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBBP0CG47 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBBP0CG47 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBBP0CG47 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBBP0CG47 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBBP0CG47 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBBP0CG47 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBBP0CG47 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBBP0CG47 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBBP0CG47 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBBP0CG47 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBBP0CG47 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBBP0CG47 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBBP0CG47 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBBP0CG47 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBBP0CG47 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBBP0CG47 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBBP0CG47 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBBP0CG47 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBBP0CG47 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBBP0CG47 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBBP0CG47 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBBP0CG47 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBBP0CG47 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBBP0CG47 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBBP0CG47 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBBP0CG47 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBBP0CG47 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBBP0CG47 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBBP0CG47 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBBP0CG47 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBBP0CG47 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBBP0CG47 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBBP0CG47 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBBP0CG47 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBBP0CG47 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBBP0CG47 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBBP0CG47 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBBP0CG47 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBBP0CG47 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBBP0CG47 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBBP0CG47 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms