Protein–RNA interactions for Protein: P07477

PRSS1, Trypsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS1P07477 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRSS1P07477 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRSS1P07477 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRSS1P07477 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRSS1P07477 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRSS1P07477 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRSS1P07477 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRSS1P07477 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRSS1P07477 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS1P07477 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS1P07477 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRSS1P07477 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRSS1P07477 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRSS1P07477 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRSS1P07477 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRSS1P07477 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRSS1P07477 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRSS1P07477 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRSS1P07477 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS1P07477 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS1P07477 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRSS1P07477 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRSS1P07477 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRSS1P07477 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRSS1P07477 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRSS1P07477 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS1P07477 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRSS1P07477 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS1P07477 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRSS1P07477 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRSS1P07477 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRSS1P07477 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRSS1P07477 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS1P07477 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS1P07477 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS1P07477 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS1P07477 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRSS1P07477 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRSS1P07477 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRSS1P07477 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRSS1P07477 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRSS1P07477 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRSS1P07477 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRSS1P07477 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRSS1P07477 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRSS1P07477 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRSS1P07477 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRSS1P07477 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRSS1P07477 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRSS1P07477 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRSS1P07477 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRSS1P07477 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRSS1P07477 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRSS1P07477 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRSS1P07477 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRSS1P07477 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRSS1P07477 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRSS1P07477 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRSS1P07477 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRSS1P07477 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRSS1P07477 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRSS1P07477 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRSS1P07477 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRSS1P07477 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRSS1P07477 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRSS1P07477 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRSS1P07477 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS1P07477 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS1P07477 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRSS1P07477 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS1P07477 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRSS1P07477 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS1P07477 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRSS1P07477 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRSS1P07477 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRSS1P07477 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRSS1P07477 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRSS1P07477 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRSS1P07477 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRSS1P07477 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRSS1P07477 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRSS1P07477 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRSS1P07477 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRSS1P07477 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRSS1P07477 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRSS1P07477 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRSS1P07477 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRSS1P07477 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRSS1P07477 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRSS1P07477 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRSS1P07477 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRSS1P07477 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRSS1P07477 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRSS1P07477 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRSS1P07477 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRSS1P07477 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PRSS1P07477 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRSS1P07477 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRSS1P07477 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRSS1P07477 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms