Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J244

TRAV3, T-cell receptor alpha variable 3 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV3A0A0B4J244 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAV3A0A0B4J244 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAV3A0A0B4J244 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAV3A0A0B4J244 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAV3A0A0B4J244 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAV3A0A0B4J244 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAV3A0A0B4J244 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAV3A0A0B4J244 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAV3A0A0B4J244 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAV3A0A0B4J244 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAV3A0A0B4J244 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAV3A0A0B4J244 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAV3A0A0B4J244 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAV3A0A0B4J244 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAV3A0A0B4J244 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAV3A0A0B4J244 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAV3A0A0B4J244 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAV3A0A0B4J244 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAV3A0A0B4J244 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAV3A0A0B4J244 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAV3A0A0B4J244 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAV3A0A0B4J244 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAV3A0A0B4J244 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAV3A0A0B4J244 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV3A0A0B4J244 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAV3A0A0B4J244 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAV3A0A0B4J244 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAV3A0A0B4J244 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAV3A0A0B4J244 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAV3A0A0B4J244 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAV3A0A0B4J244 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAV3A0A0B4J244 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAV3A0A0B4J244 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAV3A0A0B4J244 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAV3A0A0B4J244 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAV3A0A0B4J244 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAV3A0A0B4J244 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAV3A0A0B4J244 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAV3A0A0B4J244 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAV3A0A0B4J244 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAV3A0A0B4J244 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAV3A0A0B4J244 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAV3A0A0B4J244 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAV3A0A0B4J244 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAV3A0A0B4J244 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAV3A0A0B4J244 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAV3A0A0B4J244 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAV3A0A0B4J244 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAV3A0A0B4J244 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAV3A0A0B4J244 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAV3A0A0B4J244 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAV3A0A0B4J244 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAV3A0A0B4J244 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAV3A0A0B4J244 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAV3A0A0B4J244 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV3A0A0B4J244 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAV3A0A0B4J244 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAV3A0A0B4J244 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAV3A0A0B4J244 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAV3A0A0B4J244 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAV3A0A0B4J244 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAV3A0A0B4J244 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAV3A0A0B4J244 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAV3A0A0B4J244 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAV3A0A0B4J244 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAV3A0A0B4J244 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAV3A0A0B4J244 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAV3A0A0B4J244 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAV3A0A0B4J244 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV3A0A0B4J244 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV3A0A0B4J244 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAV3A0A0B4J244 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV3A0A0B4J244 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV3A0A0B4J244 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAV3A0A0B4J244 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAV3A0A0B4J244 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAV3A0A0B4J244 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAV3A0A0B4J244 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAV3A0A0B4J244 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAV3A0A0B4J244 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAV3A0A0B4J244 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV3A0A0B4J244 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV3A0A0B4J244 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV3A0A0B4J244 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAV3A0A0B4J244 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAV3A0A0B4J244 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAV3A0A0B4J244 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV3A0A0B4J244 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV3A0A0B4J244 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV3A0A0B4J244 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAV3A0A0B4J244 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAV3A0A0B4J244 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAV3A0A0B4J244 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV3A0A0B4J244 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV3A0A0B4J244 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV3A0A0B4J244 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV3A0A0B4J244 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAV3A0A0B4J244 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV3A0A0B4J244 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV3A0A0B4J244 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms