Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM9

MEIKIN, Meiosis-specific kinetochore protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIKINA0A087WXM9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEIKINA0A087WXM9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEIKINA0A087WXM9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEIKINA0A087WXM9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEIKINA0A087WXM9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIKINA0A087WXM9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIKINA0A087WXM9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIKINA0A087WXM9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIKINA0A087WXM9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIKINA0A087WXM9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIKINA0A087WXM9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIKINA0A087WXM9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIKINA0A087WXM9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIKINA0A087WXM9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIKINA0A087WXM9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIKINA0A087WXM9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEIKINA0A087WXM9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIKINA0A087WXM9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIKINA0A087WXM9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIKINA0A087WXM9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIKINA0A087WXM9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIKINA0A087WXM9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIKINA0A087WXM9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIKINA0A087WXM9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIKINA0A087WXM9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIKINA0A087WXM9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIKINA0A087WXM9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIKINA0A087WXM9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEIKINA0A087WXM9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIKINA0A087WXM9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIKINA0A087WXM9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEIKINA0A087WXM9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEIKINA0A087WXM9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEIKINA0A087WXM9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIKINA0A087WXM9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIKINA0A087WXM9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIKINA0A087WXM9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIKINA0A087WXM9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIKINA0A087WXM9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIKINA0A087WXM9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIKINA0A087WXM9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIKINA0A087WXM9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIKINA0A087WXM9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIKINA0A087WXM9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIKINA0A087WXM9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIKINA0A087WXM9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIKINA0A087WXM9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIKINA0A087WXM9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIKINA0A087WXM9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIKINA0A087WXM9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIKINA0A087WXM9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIKINA0A087WXM9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIKINA0A087WXM9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIKINA0A087WXM9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIKINA0A087WXM9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIKINA0A087WXM9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIKINA0A087WXM9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIKINA0A087WXM9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIKINA0A087WXM9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIKINA0A087WXM9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIKINA0A087WXM9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIKINA0A087WXM9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIKINA0A087WXM9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIKINA0A087WXM9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIKINA0A087WXM9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIKINA0A087WXM9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIKINA0A087WXM9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIKINA0A087WXM9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIKINA0A087WXM9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIKINA0A087WXM9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIKINA0A087WXM9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIKINA0A087WXM9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIKINA0A087WXM9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIKINA0A087WXM9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIKINA0A087WXM9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIKINA0A087WXM9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIKINA0A087WXM9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIKINA0A087WXM9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIKINA0A087WXM9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIKINA0A087WXM9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIKINA0A087WXM9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIKINA0A087WXM9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIKINA0A087WXM9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIKINA0A087WXM9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIKINA0A087WXM9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIKINA0A087WXM9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIKINA0A087WXM9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIKINA0A087WXM9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIKINA0A087WXM9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIKINA0A087WXM9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIKINA0A087WXM9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIKINA0A087WXM9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIKINA0A087WXM9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIKINA0A087WXM9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIKINA0A087WXM9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIKINA0A087WXM9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIKINA0A087WXM9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIKINA0A087WXM9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIKINA0A087WXM9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIKINA0A087WXM9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms