Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5SQ99766 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5SQ99766 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms