Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms