Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC17Q96LX7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms