Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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