Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RPL14-206ENST00000465280 616 ntTSL 213□□□□□ -0.339e-9■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 GOT2-205ENST00000496461 981 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.558e-9■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 GOT2-206ENST00000564400 983 ntTSL 310.19□□□□□ -0.788e-9■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.978e-9■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A13-203ENST00000472162 568 ntTSL 414.4□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 ZFX-207ENST00000459724 673 ntTSL 519.77■□□□□ 0.764e-11■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 314.84□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 CDC45-209ENST00000483431 712 ntTSL 514.45□□□□□ -0.15e-13■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 MX2-209ENST00000482953 3595 ntTSL 27.6□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 PPP6R1-206ENST00000591323 848 ntTSL 313.75□□□□□ -0.219e-8■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPA1-206ENST00000554259 3354 ntTSL 52.06□□□□□ -2.081e-9■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPA1-208ENST00000554573 2358 ntTSL 51.57□□□□□ -2.161e-9■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.359e-8■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 TRNT1-208ENST00000434583 1871 ntTSL 28.77□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 ITSN1-218ENST00000440794 936 ntTSL 57.64□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 ITSN1-214ENST00000419241 779 ntTSL 56.86□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 SUN1-233ENST00000488628 626 ntTSL 414.77□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ACSS2-207ENST00000470315 623 ntTSL 38.98□□□□□ -0.971e-11■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 TF-204ENST00000461695 990 ntTSL 38.56□□□□□ -1.046e-14■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 PHF10-203ENST00000464779 676 ntTSL 5-0.98□□□□□ -2.576e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 PMPCA-209ENST00000619192 416 ntTSL 218.15■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 SERPINB1-202ENST00000460260 580 ntTSL 217.87■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 SERPINB1-205ENST00000490094 782 ntTSL 515.51■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 DUS3L-213ENST00000592491 806 ntTSL 513.31□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 PLK1-204ENST00000564202 584 ntTSL 313.16□□□□□ -0.39e-11■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 PLK1-208ENST00000568568 582 ntTSL 313.11□□□□□ -0.319e-11■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 SERPINB1-204ENST00000476896 872 ntTSL 512.67□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 GALK2-212ENST00000559454 1768 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 GALK2-216ENST00000560031 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 GALK2-202ENST00000396509 1834 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.099e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 GALK2-217ENST00000560119 2053 ntTSL 27.74□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.189e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 GALK2-203ENST00000544523 1950 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.296e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.676e-33■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 CDC25A-205ENST00000459900 767 ntTSL 33.95□□□□□ -1.781e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 PRKDC-209ENST00000540819 537 ntTSL 31.74□□□□□ -2.134e-12■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 U2SURP-207ENST00000472373 1182 ntTSL 20.45□□□□□ -2.349e-11■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 SCAF11-209ENST00000547018 3271 ntTSL 510.69□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 IL4R-210ENST00000563886 734 ntTSL 211.53□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 IL4R-215ENST00000565915 541 ntTSL 410.66□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 IL4R-212ENST00000565179 579 ntTSL 310.19□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 IL4R-213ENST00000565352 424 ntTSL 59.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 TRNT1-211ENST00000482311 447 ntTSL 30.89□□□□□ -2.272e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 NARS-204ENST00000586807 1608 ntTSL 28.98□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.739e-10■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RAPGEF6-214ENST00000515170 4103 ntTSL 28.72□□□□□ -1.019e-10■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.029e-10■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.679e-10■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.829e-10■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.029e-10■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 TTC17-214ENST00000534347 889 ntTSL 313.85□□□□□ -0.196e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 TTC7A-210ENST00000484337 753 ntTSL 313.56□□□□□ -0.246e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 TTC17-210ENST00000530469 559 ntTSL 32.74□□□□□ -1.976e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 INPPL1-211ENST00000541544 530 ntTSL 220.08■□□□□ 0.815e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.018e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.328e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 211.36□□□□□ -0.598e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.778e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 59.69□□□□□ -0.868e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.128e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.128e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.268e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.268e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 36.68□□□□□ -1.348e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.48e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.428e-13■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.116e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 BLOC1S2-201ENST00000361832 425 ntTSL 512.04□□□□□ -0.486e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 BLOC1S2-203ENST00000441611 2024 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.186e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.646e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 BLOC1S2-204ENST00000579542 360 ntTSL 22.87□□□□□ -1.956e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 SLC4A7-204ENST00000428005 1572 ntTSL 1 (best)18.73■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 FARP1-237ENST00000601853 749 ntTSL 513.72□□□□□ -0.213e-12■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 FARP1-220ENST00000596613 856 ntTSL 56.86□□□□□ -1.313e-12■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.034e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 MACF1-218ENST00000484393 750 ntTSL 25.11□□□□□ -1.599e-9■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 STAT1-209ENST00000452281 2594 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 POLR2A-204ENST00000575547 702 ntTSL 35.66□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.2□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 33.8
PRPF8Q6P2Q9 MTHFD1-210ENST00000555252 2053 ntTSL 1 (best)7.74□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 33.8
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 458.3 ms