Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6CQ53S08 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms