Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC153Q494R4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms