Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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